Ключовата разлика между ДНК транспозоните и ретротранспозоните е, че ДНК транспозоните са мобилни генетични елементи, които се преместват от едно място на друго в генома чрез използване на механизъм за изрязване и поставяне, докато ретротранспозоните са мобилни генетични елементи, които се преместват от едно място към друг в генома чрез използване на механизма за копиране и поставяне.
Мобилните генетични елементи (MGEs) са сегменти от ДНК, които кодират специфични ензими и протеини, които медиират тяхното движение в генома или които могат да се прехвърлят от един вид на друг. Те са известни също като егоистични генетични елементи. Транспонируемите елементи представляват един от няколкото вида мобилни генетични елементи. Има два основни вида транспозируеми елементи: ДНК транспозони и ретротранспозони. Следователно ДНК транспозоните и ретротранспозоните са мобилни генетични елементи, които могат да се движат от място на място в генома.
Какво представляват ДНК транспозони?
ДНК транспозоните са мобилни генетични елементи, които се преместват от едно място на друго в генома чрез използване на механизъм за изрязване и поставяне. Те принадлежат към преносими елементи от клас II, които се движат през ДНК междинен продукт. Това се противопоставя на преносими елементи от клас I (ретротранспозони), които се движат през РНК междинен продукт. Обикновено ДНК транспозоните се движат в генома чрез метода на изрязване и поставяне. Този метод изисква ензим транспозаза, който катализира движението на ДНК от текущото й местоположение в генома и вмъкването в новото място.
Фигура 01: ДНК транспозони
Това транспониране изисква три ДНК места на транспозона (две във всеки край на транспозона, наречени крайни инвертирани повторения, и едно в целевото място). Ензимът транспозаза ще се свърже с крайните обърнати повторения на транспозона и ще медиира синапса на краищата на транспозона. След това ензимът транспозаза изключва елемента от страничната ДНК на оригиналното донорно място и медиира свързването на транспозона към новото място на вмъкване в генома. Добавянето на транспозон към новото място причинява къси празнини от двете страни на вмъкнатия сегмент. Хост системите поправят тези пропуски, което води до дублиране на целевата последователност (TSD), което е характерно за транспонирането.
Какво представляват ретротранспозоните?
Ретротранспозоните са мобилни генетични елементи, които се преместват от едно място на друго в генома чрез използване на механизъм за копиране и поставяне. Те принадлежат към преносими елементи от клас I. Транспозируемите елементи от клас I (ретротранспозони) се движат през РНК междинен продукт в генома. Те са вид генетичен компонент, който се копира и поставя в различни геномни местоположения.
Фигура 02: Ретротранспозони
Първо, те се транскрибират от ДНК на РНК. След това произведената РНК се транскрибира обратно в ДНК. Тази копирана ДНК по-късно се вмъква обратно в генома на ново място. Обратната транскрипция се катализира от обратна транскриптаза. Обратната транскриптаза често се кодира от самия ретротранспозон. Интегрирането се осъществява от ензим, наречен интеграза. Освен това обикновено има три вида: дълги крайни повторения (LTR), дълги разпръснати ядрени елементи (LINE) и къси разпръснати ядрени елементи (SINE).
Какви са приликите между ДНК транспозони и ретротранспозони?
- ДНК транспозоните и ретротранспозоните са мобилни генетични елементи.
- И двете са класифицирани като транспонируеми елементи.
- И двата са известни като скачащи гени.
- Могат да се местят от място на място в генома.
- Те са еволюционно много важни.
Каква е разликата между ДНК транспозони и ретротранспозони?
ДНК транспозоните са мобилни генетични елементи, които се преместват от едно място на друго в генома чрез използване на механизъм за изрязване и поставяне, докато ретротранспозоните са мобилни генетични елементи, които се преместват от едно място на друго в генома чрез използване на копие и механизъм за поставяне. По този начин, това е ключовата разлика между ДНК транспозони и ретротранспозони. Освен това, ДНК транспозоните принадлежат към преносими елементи от клас II, докато ретротранспозоните принадлежат към преносими елементи от клас I.
Инфографиката по-долу представя разликите между ДНК транспозони и ретротранспозони в таблична форма за сравнение едно до друго.
Обобщение – ДНК транспозони срещу ретротранспозони
ДНК транспозоните и ретротранспозоните са мобилни генетични елементи. ДНК транспозоните се преместват от едно място на друго в генома чрез използване на механизъм за изрязване. Ретротранспозоните се преместват от едно място на друго в генома чрез използване на механизъм за копиране и поставяне. И така, това обобщава разликата между ДНК транспозони и ретротранспозони.