Ключовата разлика между T4 ДНК лигаза и E. coli ДНК лигаза е, че T4 ДНК лигаза е ензим, който е изолиран от бактериофаг T4, докато E. coli ДНК лигаза е ензим, който е изолиран от бактерията E. coli.
ДНК лигазата е специфичен вид ензим, който улеснява свързването на ДНК вериги чрез образуването на фосфодиестерна връзка. Той играе важна роля, като поправя едноверижни скъсвания и двуверижни скъсвания в ДНК на живите организми. Освен това ДНК лигазата се използва както при възстановяването на ДНК, така и при репликацията на ДНК. Освен горните употреби, ДНК лигазата също има широко приложение в експерименти с молекулярна биология, като например рекомбинантна ДНК технология. Т4 ДНК лигаза и Е. coli ДНК лигаза са два типа ДНК лигаза ензими.
Какво е T4 ДНК лигаза?
Т4 лигазата е ензим, свързващ ДНК, който е изолиран от бактериофаг Т4. Т4 бактериофагът е вирус, който заразява Escherichia coli. Ензимът Т4 лигаза е най-често използваната ДНК лигаза в молекулярно-биологичните лабораторни изследвания. Обикновено Т4 лигазата катализира свързването на две кохезивни или тъпи краища на двуверижна ДНК между 5' фосфатните и 3' хидроксилните групи на съседни нуклеотиди. Той може също да катализира свързването на РНК към ДНК или РНК верига в дуплексна молекула. Въпреки това, този ензим няма да се присъедини към едноверижни нуклеинови киселини. Освен това, той може също да лигира ДНК с тъпи краища с много по-голяма ефективност от ДНК лигазата на Е. coli.
Фигура 01: Т4 ДНК лигаза
Този ензим изисква АТФ като кофактор. Някои изследователски експерименти в областта на генното инженерство вече са произвели по-активни ензими ДНК лигаза от дивия тип Т4 ДНК лигаза. В един от подходите, те създадоха молекула на слят ензим чрез смесване на T4 ДНК лигаза до p50 или NF-kB молекула. Този нов ензим Т4 лигаза е 160% по-активен при връзки с тъп край за целите на клонирането, отколкото дивия тип Т4 ДНК лигаза. Освен това, оптималната температура за T4 ДНК лигаза за по-прецизно катализиране на реакцията на лигиране е 16 °C.
Какво е E Coli ДНК лигаза?
E. coli ДНК лигазата е ензим, който се изолира от E. coli бактерии. Генът, отговорен за производството на ДНК лигаза на E. coli, е lig ген. Е. coli ДНК, лигазата, както и повечето прокариотни ДНК лигази, използват енергията, получена от NAD (никотинамид аденин динуклеотид), за да създадат фосфодиестерната връзка.
Фигура 02: E. Coli ДНК лигаза
E. coli ДНК лигаза е ензим за лигиране, който може да свързва ДНК фрагменти чрез катализиране на образуването на фосфодиестерни връзки между двойноверижни ДНК фрагменти, съдържащи 5' фосфатни краища и 3' хидроксилни краища. Освен това, той не лигира ДНК с тъпи краища, освен при специални условия като молекулярно струпване с полиетилен гликол. Той също така не може да свърже ефективно РНК с ДНК. Освен това, активността на ДНК лигазата на Е. coli може да се засили чрез присъствието на ДНК полимераза 1 в правилната концентрация. Въпреки това, когато концентрацията на ензима ДНК полимераза 1 е по-висока, това има неблагоприятни ефекти върху активността на ДНК лигазата на Е. coli.
Какви са приликите между T4 ДНК лигаза и E Coli ДНК лигаза?
- T4 ДНК лигаза и E-coli ДНК лигаза са два типа ДНК лигаза ензими.
- И двата са протеини, съставени от аминокиселини.
- Тези ензими катализират образуването на фосфодиестерна връзка между разположените една до друга 5' фосфатни и 3' хидроксилни краища в дуплексна ДНК.
- Те имат широко приложение в експерименти с молекулярна биология, като например рекомбинантна ДНК технология.
Каква е разликата между T4 ДНК лигаза и E Coli ДНК лигаза?
T4 ДНК лигаза е ензим, който е изолиран от бактериофаг Т4, докато E. coli ДНК лигаза е ензим, който е изолиран от E. coli бактерии. По този начин, това е ключовата разлика между T4 ДНК лигаза и E. coli ДНК лигаза. Освен това източникът на енергия за Т4 ДНК лигаза е АТФ. От друга страна, източникът на енергия за ДНК лигазата на Е. coli е NAD.
Инфографиката по-долу представя разликите между T4 ДНК лигаза и E coli ДНК лигаза в таблична форма за едно до друго сравнение.
Обобщение – T4 ДНК лигаза срещу E Coli ДНК лигаза
T4 ДНК лигаза и E. coli ДНК лигаза са два ензима, които катализират образуването на фосфодиестерна връзка между разположените една до друга 5’ фосфатни и 3’ хидроксилни краища в дуплексна ДНК. Т4 лигазата е ензим, който е изолиран от бактериофаг Т4, докато Е. coli ДНК лигазата е ензим, който е изолиран от Е. coli бактерии. И така, това е ключовата разлика между T4 ДНК лигаза и E coli ДНК лигаза.
