Ключовата разлика между кандидат-гена и GWAS е, че кандидат-генният подход изследва генетичната вариация в рамките на малък брой предварително определени гени, представляващи интерес, докато GWAS изследва целия геном за обща генетична вариация зад определено болестно състояние.
Подходът на кандидат-гените и проучванията за асоцииране на целия геном (GWAS) са два метода, които са важни за откриване на генетична чувствителност към заболявания. Подходът на кандидат-ген се основава на предварително определен малък брой гени, докато GWAS се основава на тестване на целия геном. Следователно подходът на кандидат-ген изисква предварително познаване на гени, които имат отношение към болестта, за разлика от GWAS.
Какво е кандидат ген?
Подходът на кандидат-ген е една от техниките, които изследват връзката между генетичните вариации в рамките на предварително определени интересни гени и фенотипове или болестни състояния. При този подход е необходимо да имате предварителни познания за биологичното функционално въздействие на гена върху въпросната черта или заболяване. Въз основа на тези знания се избират малък брой гени и се анализират за генетична вариация.
Фигура 01: Подход на кандидат-ген
Изборът на гените се прави въз основа на биологичното, физиологичното и функционалното значение за въпросното заболяване при този подход. Този подход често е проектиран като изследване на случай-контрол.
Какво е GWAS?
GWAS означава Проучване за асоцииране в целия геном. Също така се отнася до проучвания за асоцииране на целия геном. Тези проучвания се фокусират главно върху наблюдателни проучвания. Те анализират генетичните варианти на различни индивиди, обикновено свързани с определена черта. Целият геном е важен за GWAS анализа.
GWAS е важен инструмент при анализа на единични нуклеотидни полиморфизми, свързани с различни болестни състояния. Това е сравнително изследване на различните единични нуклеотидни полиморфизми в широка популация. Проучвателната извадка на GWAS е много висока; следователно, то също приема формата на междусекторно кохортно проучване.
Фигура 02: GWAS
Първото проучване на GWAS се проведе по отношение на инфаркт на миокарда и анализиране на гените, свързани с инфаркт на миокарда. Понастоящем GWAS играе важна роля в определянето на генетичния фон на сложни заболявания с неизвестна етиология.
Какви са приликите между кандидат гена и GWAS?
- Както кандидат генният подход, така и GWAS са техники, които анализират генетичната връзка между генотипа и фенотипа на заболяването.
- И двата подхода помагат да се разбере генетичната основа на чувствителността към болести.
Каква е разликата между кандидат ген и GWAS?
Подходът на кандидат-гените се основава на кандидат-гените или предварително определени гени, докато GWAS се основава на целия геном. И така, това е ключовата разлика между кандидат гена и GWAS. Също така, при подхода на кандидат гена, изборът на гени е необходим, докато не е необходим в GWAS.
Освен това подходът на кандидат-ген изисква предварителни познания за гените, свързани с болестта, докато не е необходим за GWAS.
Инфографиката по-долу предоставя по-подробно сравнение, свързано с разликата между кандидат ген и GWAS.
Резюме – Кандидат ген срещу GWAS
Кандидат генът и GWAS са две проучвания за асоцииране на гени. Подходът на кандидат гена се фокусира върху генетичната вариация, свързана с болестта в рамките на малък брой предварително определени гени. За разлика от това, GWAS изследва генетичните вариации, свързани с болестта в рамките на целия геном. И така, това е ключовата разлика между кандидат гена и GWAS. И двата метода са важни за разбирането на генетичната основа на податливостта към болести.
