Ключовата разлика между свободната от клетки ДНК и циркулиращата туморна ДНК е, че свободната от клетки ДНК представлява различни форми на ДНК, които свободно циркулират в кръвта, докато циркулиращата туморна ДНК е фрагментирана ДНК, получена от тумор, която циркулира в кръвта.
Неклетъчната ДНК и циркулиращата туморна ДНК са два вида циркулиращи нуклеинови киселини. Циркулиращите нуклеинови киселини са открити от Мандел и Метал през 1948 г. По-късно беше открито, че количеството на циркулиращите нуклеинови киселини при болни пациенти е значително високо. Това откритие е направено за първи път във връзка с пациенти с лупус. Освен това циркулиращите нуклеинови киселини имат по-висока прогностична стойност и могат да се използват като биомаркер за откриване на различни заболявания.
Какво е безклетъчна ДНК?
Свободна от клетки ДНК (Cf ДНК) се отнася до различни форми на ДНК, като циркулираща туморна ДНК, безклетъчна митохондриална ДНК и безклетъчна фетална ДНК и др., които свободно циркулират в кръвта. Повишените нива на безклетъчна ДНК се наблюдават при напреднали заболявания като рак, травма, сепсис, инфаркт на миокарда, диабет, инсулт, сърповидно-клетъчна анемия и др. В допълнение към рака и феталната медицина, безклетъчната ДНК е полезен биомаркер за множество заболявания. Тази ДНК може да се използва и за откриване на отхвърляне на трансплантант. Те се използват и при определяне на обикновен стрес, пренатално разпознаване на пола и при тестване за бащинство.
Фигура 01: Безклетъчна ДНК
Свободната от клетки ДНК обикновено е двуверижна извънклетъчна молекула на ДНК. Състои се от малки фрагменти (50 до 200 bp) и по-големи фрагменти (21 kb). Освен това, той вече е признат за надежден биомаркер за диагностика на рак на простатата и гърдата. Свободната от клетки ДНК циркулира предимно в кръвния поток като нуклеозоми. Нуклеозомите са ядрени комплекси от хистони и ДНК. Cf ДНК може да бъде количествено определена с помощта на различни техники като PCR, масивно паралелно секвениране, ултравиолетова спектрометрия, PicoGreen оцветяване и ELISA. Тъй като откриването на Cf ДНК в кръвния поток е бърз, лесен, неинвазивен, повтарящ се метод, в бъдеще то ще бъде потенциален биомаркер за диагностициране на множество заболявания като автоимунни ревматични заболявания и тумори.
Какво е циркулираща туморна ДНК?
Циркулиращата туморна ДНК (Ct ДНК) е фрагментираната туморна ДНК, която циркулира в кръвта. Има туморен произход. Тъй като циркулиращият тумор може да отразява целия туморен геном, той придоби широка привлекателност за потенциалната си полезност в клинични условия. Течни биопсии, които изтеглят кръв, могат да се използват за тестване на циркулиращи тумори.
Фигура 02: Циркулираща туморна ДНК
Биологичните процеси, които вероятно участват в освобождаването на Ct ДНК, включват апоптоза и некроза от умиращи клетки или активно освобождаване от туморни клетки. В здравите тъкани инфилтриращите фагоцити могат да изчистят Ct ДНК. Освен това могат да се използват различни техники за анализиране на циркулираща туморна ДНК, като дигитален PCR с капчици, BEAMing, CAPP-Seq (дълбоко секвениране), безопасно секвениране и дуплексно секвениране.
Какви са приликите между безклетъчна ДНК и циркулираща туморна ДНК?
- Неклетъчната ДНК и циркулиращата туморна ДНК са два вида циркулиращи нуклеинови киселини.
- Изградени са от нуклеотиди.
- И двата вида могат да се използват като потенциални маркери за диагностициране на различни заболявания в клинични условия.
- Намират се в кръвта.
- И двете са извънклетъчни форми на ДНК молекули.
- И двете се изчистват чрез инфилтриране на фагоцити.
Каква е разликата между безклетъчна ДНК и циркулираща туморна ДНК?
Свободната от клетките ДНК са различни форми на ДНК като циркулираща туморна ДНК, безклетъчна митохондриална ДНК и безклетъчна фетална ДНК и др., които свободно циркулират в кръвта, докато циркулиращата туморна ДНК е фрагментираната туморна ДНК който циркулира в кръвта. И така, това е ключовата разлика между свободната от клетки ДНК и циркулиращата туморна ДНК. Освен това свободната от клетки ДНК циркулира във фрагменти, вариращи от 50-220 bp, докато циркулиращата туморна ДНК циркулира във фрагменти, вариращи от 134-144 bp.
Следващата инфографика представя разликата между безклетъчна ДНК и циркулираща туморна ДНК в таблична форма за сравнение едно до друго.
Обобщение – Безклетъчна ДНК срещу циркулираща туморна ДНК
Циркулиращите нуклеинови киселини се изхвърлят в кръвта чрез регулирани или случайни механизми. Безклетъчна ДНК и циркулираща туморна ДНК са два вида циркулиращи нуклеинови киселини. Свободната от клетки ДНК са различни форми на ДНК като циркулираща туморна ДНК, свободна от клетки митохондриална ДНК, свободна от клетки фетална ДНК, която свободно циркулира в кръвта, докато циркулиращата туморна ДНК е фрагментираната туморна ДНК, която циркулира в кръвта. По този начин това обобщава разликата между безклетъчна ДНК и циркулираща туморна ДНК.
