Ключова разлика – YAC срещу BAC вектори
Векторите се използват в молекулярното клониране. Вектор може да се дефинира като ДНК молекула, която се държи като средство за пренасяне на чужд генетичен материал в друга клетка. Вектор, съдържащ чужда ДНК, е известен като рекомбинантна ДНК и трябва да има способността да я репликира и експресира в организма гостоприемник. Дрождената изкуствена хромозома (YAC) и бактериалната изкуствена хромозома (BAC) са два вида вектори, участващи в клонирането. Ключовата разлика между YAC и BAC е, че YAC е изкуствено конструирана векторна система, използваща специфичен регион на дрождева хромозома за вмъкване на големи сегменти от генетични материали в дрождеви клетки, докато BAC е изкуствено конструирана векторна система, използваща специфичен регион на E.coli хромозома за вмъкване на големи сегменти от ДНК в клетките на E. coli.
Какво представляват YAC векторите?
YAC (изкуствена хромозома на дрожди) е изкуствено изградена хромозома, която има способността да носи голям сегмент от чужда ДНК и да се репликира в клетките на дрождите. Той има центромер, теломери, както и автономно репликиращи се последователности, които са от съществено значение за репликацията и стабилността. YAC трябва също да носи селективен маркер или маркери и рестрикционни сайтове, за да бъде ефективен вектор за клониране. Голяма последователност, варираща от 1000 kb до 2000 kb, може да бъде вмъкната в YAC и прехвърлена в дрожди. Ефективността на трансформация на YAC е много ниска.
Фигура 01: YAC вектор
Какво представляват BAC векторите?
Бактериалната изкуствена хромозома (BAC) е изкуствено конструирана хромозома за молекулярно клониране. Той има специфични региони на E. coli F плазмид и е кръгъл и супер навит. BAC е разработен за клониране на ДНК фрагменти към бактерии, особено към E. coli. Може да носи ДНК фрагменти с размери до 300 kb. В сравнение с YAC, вложките за клониране на BAC са с по-малки размери. BAC са разработени през 1992 г. и все още са популярни поради своята стабилност и лесна конструкция. BAC също са полезни при разработването на ваксини.
Фигура 02: BAC вектор в молекулярно клониране
Каква е разликата между YAC и BAC вектори?
YAC срещу BAC вектори |
|
| YAC е генетично модифицирана хромозома с използване на ДНК на дрожди за целите на клониране. | BAC е генетично проектирана ДНК молекула, използваща ДНК на E. coli за целите на клониране. |
| Пол | |
| YAC са проектирани да клонират големи фрагменти от геномна ДНК в дрожди. | BAC са разработени за клониране на големи геномни фрагменти в Escherichia coli. |
| Вмъкване на дължина | |
| YAC могат да съдържат геномни вложки с мегабазов размер. (1000 kb – 2000 kb). | BAC могат да носят вмъквания от 200–300 kb или по-малко. |
| Строителство | |
| YAC ДНК е трудно да се пречисти непокътната и изисква висока концентрация за генериране на YAC векторна система. | BAC лесно се пречиства непокътнат и може лесно да се конструира. |
| Химеризъм | |
| YAC често са химерни. | BAC рядко са химерични. |
| Стабилност | |
| YAC е нестабилен. | BAC е стабилен. |
| Модификации | |
| Рекомбинацията на дрождите е много осъществима и винаги остава активна. Следователно може да генерира изтривания и други пренареждания в YAC. | E. coli рекомбинацията се предотвратява и се включва, когато е необходимо. Следователно намалява нежеланите пренареждания в BACs. |
| Поддръжка | |
| Манипулирането на рекомбинантни YAC обикновено изисква YAC да бъде прехвърлен в E. coli за последваща манипулация. Следователно това е трудоемък процес. | BAC модификацията възниква директно в E. coli. Така че няма нужда от трансфер на ДНК. Следователно процесът не е трудоемък. |
Резюме – YAC срещу BAC вектори
YAC се превърна в основен изследователски инструмент в процесите на клониране поради способността му да клонира големи фрагменти от ДНК в организма гостоприемник. Въпреки това, YACs имат няколко недостатъка като вектори, като трудности при изграждането, химеризъм, нестабилност и т.н. Следователно, за да преодолеят тези проблеми, учените са разработили BAC вектори. BAC е конструиран с помощта на специфични региони на хромозомата на Е. coli. Той е стабилен вектор и може лесно да бъде конструиран. Въпреки това дължината на ДНК, с която BAC може да се справи, е до 20 пъти по-малка от тази на YAC. Това е разликата между векторните системи YAC и BAC. В наши дни BAC е по-предпочитан пред YAC в лабораториите.
