Ключовата разлика между Rho-зависимото и Rho-независимото терминиране е, че при Rho-зависимото терминиране, Rho факторът се свързва с транскрипта и прекратява транскрипцията чрез прекъсване на водородните връзки между шаблона и транскрипта, докато Rho-независимото терминиране прекъсва транскрипцията чрез създаване на структура с примка на фиби и след това богата на U област в транскрипта.
Транскрипцията е един от двата етапа на генната експресия. Това е процесът, който произвежда иРНК последователност от генетичната информация, скрита в ДНК последователността на гена. Транскрипцията се осъществява чрез три стъпки: иницииране, удължаване и терминиране. Ензимът РНК полимераза се свързва с промоторната последователност на гена и започва да катализира синтеза на РНК веригата. Докато се намери терминаторната последователност, РНК полимеразата добавя нуклеотиди и изгражда РНК веригата. При прокариотите терминирането става чрез две основни стратегии за терминиране: Rho зависимо терминиране и Rho независимо терминиране. Rho факторът е протеин, който има хеликазазна активност.
Какво е Rho зависимо прекратяване?
Rho зависимото терминиране е един от двата вида стратегии за терминиране на транскрипция, срещащи се при прокариотите. Rho факторът е протеин, който има хеликазазна активност.
Фигура 01: Зависимо прекратяване на Rho
Rho протеинът се свързва с РНК транскрипта и се движи по РНК полимеразата в посока 5’-3’, насърчавайки дисоциацията на водородните връзки между ДНК матрицата и РНК транскрипта. Когато Rho факторът достигне транскрипционния балон, той разкъсва ДНК/РНК хибрида и освобождава транскрипта от транскрипционния балон. Когато това се случи, прекратява транскрипцията.
Какво е независимо прекратяване на Rho?
Rho независимото прекъсване е втората стратегия, която прекъсва прокариотната транскрипция. Обикновено терминаторната област има обърната повтаряща се последователност. Непосредствено след инвертираната повтаряща се последователност има регион, богат на аденин (AAAA). Когато РНК полимеразата се движи напред, тя произвежда иРНК последователност. Тъй като двата региона са комплементарни в областта на инвертираната повтаряща се последователност, тя образува структура с примка на фиби поради водородно свързване. Следващият регион ще бъде U богатият регион. Структурата на фиби спира активността на РНК полимеразата.
Фигура 02: Независимо прекратяване на Rho
Освен това, в регионите, богати на U, има слаби взаимодействия между U базите на транскрипта и A базите на шаблона. Тези слаби връзки аденин-урацил дестабилизират ДНК матрицата и РНК транскрипта и се разделят взаимно. В крайна сметка преписът се освобождава от мястото на преписване.
Какви са приликите между Rho зависимо и Rho независимо прекратяване?
- Rho-зависимата и Rho-независимата терминация са две основни стратегии за терминация, открити при прокариотите.
- И двете форми освобождават транскрипт от ДНК шаблона, за да прекратят транскрипцията.
Каква е разликата между Rho зависимо и Rho независимо прекратяване?
Rho зависимото прекратяване се медиира от Rho протеин, докато Rho независимото прекратяване се осъществява чрез образуването на структура с примка на фиби. И така, това е ключовата разлика между Rho зависимо и Rho независимо прекратяване. Освен това, Rho протеинът използва ATP енергия, докато Rho независимото прекратяване не включва Rho протеин и не използва ATP енергия. Следователно, това също е значителна разлика между Rho зависимо и Rho независимо прекратяване.
Инфографиката по-долу показва повече сравнения, свързани с разликата между Rho зависимо и Rho независимо прекратяване.
Резюме – Rho зависимо срещу Rho независимо прекратяване
Rho-зависимото и Rho-независимото терминиране са двата основни механизма за терминиране на транскрипция, срещащи се в прокариотите. Rho протеин е отговорен за терминирането на транскрипция при Rho зависимо терминиране. За разлика от това, Rho независимото прекъсване се осъществява чрез образуване на структура на бримка на фиби. И така, това е ключовата разлика между Rho зависимо и Rho независимо прекратяване.
