Ключовата разлика между последователността на Shine Dalgarno и Kozak е, че последователността на Shine Dalgarno е рибозомно свързващо място в бактериална и археална информационна РНК, докато последователността на Kozak е място за иницииране на протеинова транслация в повечето еукариотни информационни РНК.
Shine Dalgarno и последователността на Kozak са две консенсусни последователности, които са много важни за инициирането на превода. В молекулярната биология транслацията е процесът, чрез който рибозомите в цитоплазмата синтезират протеини след процеса на транскрипция. В превод иРНК (информационна РНК) се декодира в рибозома, за да произведе специфична аминокиселинна верига извън ядрото. Обикновено рибозомата индуцира процеса на декодиране чрез улесняване на свързването на комплементарни tRNA антикодонови последователности към mRNA кодони. Преводът протича на три етапа: начало, удължаване и прекратяване.
Какво е Shine Dalgarno Sequence?
Shine Dalgarno последователността е рибозомно свързващо място в бактериална и археална информационна РНК. Обикновено се намира около 8 бази нагоре по течението на началния кодон AUG. Тази РНК последователност помага при набирането на рибозоми към информационната РНК чрез подравняване на рибозомата с начален кодон на иРНК. По този начин той инициира протеиновия синтез. Веднъж след набирането, tRNA може да добави аминокиселини в последователност, както се диктува от кодоните на mRNA. Тази специална последователност е често срещана при бактериите, но по-рядка при археите. Освен това, той също присъства в хлоропласти и митохондриални транскрипти. Последователността на Шайн Далгарно е предложена за първи път от австралийските учени Джон Шайн и Лин Далгарно. Консенсусната последователност от шест бази е AGGAGG. Например при Escherichia coli последователността е AGGAGGU.
Фигура 01: Последователност на Shine Dalgarno
Изборът на място за започване (AUG) зависи от взаимодействието между 30S субединицата на рибозомата и иРНК шаблона. Богатата на пиримидин област на 16srRNA компонента на 30S субединица се свързва с богатата на пурин област, известна като Shine Dalgarno последователност нагоре по веригата на AUG иницииращия кодон в иРНК. Освен това, по време на образуването на иницииращия комплекс, тези комплементарни нуклеотидни последователности се сдвояват, за да образуват двойноверижна РНК структура. Това улеснява свързването на иРНК към рибозома по такъв начин, че иницииращият кодон се поставя в Р мястото на рибозомата.
Какво е Kozak Sequence?
Козак последователността е място за иницииране на транслация на протеин в повечето еукариотни иРНК. Тази последователност се нарича още консенсусна последователност на Козак. Последователността на Kozak е оптималната последователност за започване на транслация в еукариоти. Тази последователност е неразделна част от регулирането на протеина. Освен това е много важно за цялостното клетъчно здраве. Той помага за коригиране на транслацията на протеини от генетични съобщения чрез посредничество при сглобяването на рибозомите и инициирането на транслацията.
Фигура 02: Последователност на Kozak
Тази последователност е кръстена на учения, който я е открил, Мерилин Козак. Тя го открива чрез подробен анализ на ДНК геномни последователности. Последователността на Kozak е 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. Главните букви показват запазени бази, докато малките букви показват общи променливи бази. R показва пурин (аденин или гуанин), който винаги е разположен на това място.
Какви са приликите между Shine Dalgarno и Kozak Sequence?
- Поредицата Shine Dalgarno и Kozak са две консенсусни поредици, които са много важни при инициирането на превода.
- И двете са РНК последователности.
- По-малката субединица на рибозомата се свързва с двете последователности.
- И двете последователности медиират правилното сглобяване на рибозома и инициирането на транслацията.
- Те са неразделна част от регулирането на протеините и цялостното клетъчно здраве.
Каква е разликата между Shine Dalgarno и Kozak Sequence?
Shine Dalgarno последователността е рибозомно свързващо място, намерено в бактериална и археална информационна РНК, докато Kozak последователността е място за иницииране на транслация на протеини, намерено в повечето еукариотни информационни РНК. И така, това е ключовата разлика между последователността Shine Dalgarno и Kozak. Освен това последователността на Shine Dalgarno е 5'AGGAGGU3', докато последователността на Kozak е 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
Следващата инфографика изброява разликите между Shine Dalgarno и последователността на Kozak в таблична форма за сравнение едно до друго.
Резюме – Shine Dalgarno срещу Kozak Sequence
Shine Dalgarno и Kozak последователности са две консенсусни РНК последователности, които са много важни за сглобяването на рибозомите и инициирането на транслацията. Последователността на Шайн Далгарно е рибозомно свързващо място в бактериална и археална информационна РНК, докато последователността на Козак е място за иницииране на протеинова транслация в повечето еукариотни информационни РНК. Така това обобщава разликата между Шайн Далгарно и последователността на Козак.
