Ключовата разлика между гуанидин тиоцианат и гуанидин хидрохлорид е, че гуанидин тиоцианатът е по-силен протеинов денатурант, който се използва по-често при изолирането на РНК, докато гуанидин хидрохлоридът е по-слаб протеинов денатурант, който се използва по-рядко при изолирането на РНК.
Денатурацията е процесът, при който протеините губят своята кватернерна структура, третична структура и вторична структура, която нормално присъства в естественото им състояние. Това може да стане чрез прилагане на външен стрес или съединения като силна киселина или основа, концентрирана неорганична сол, органичен разтворител (алкохол, хлороформ), разбъркване, радиация или топлина. Гуанидин тиоцианат и гуанидин хидрохлорид са два различни вида протеинови денатуранти.
Какво е гуанидин тиоцианат?
Гуанидин тиоцианат (GTC) е по-силен протеинов денатуриращ агент, който се използва по-често при изолиране на РНК. Известен е още като гуанидиниев изотиоцианат (GITC). Тъй като е хаотропен агент, той е химично съединение, което се използва рутинно като общ протеинов денатурант. Хаотропният агент е молекула във воден разтвор, която може да наруши мрежата от водородни връзки между водните молекули. Това има ефект върху стабилността на естественото състояние на други молекули в разтвора, като макромолекули като протеини и нуклеинови киселини чрез отслабване на хидрофобния ефект. Хаотропните агенти като гуанидин тиоцианат намаляват количеството ред в структурата на протеина, образуван от водни молекули както в насипно състояние, така и от хидратиращи обвивки около хидрофобни аминокиселини. Това може да причини денатурация на протеина.
Гуанидин тиоцианат може да се използва за деактивиране на вируси като грип, които причиняват заболявания като испанския грип през 1918 г. Поради това може да се използва в медицински или болнични условия. Освен това гуанидин тиоцианатът се използва и за лизиране на клетки и вирусни частици при екстракции на РНК и ДНК. Тук функцията на гуанидин тиоцианата е да подпомага лизиращото действие и да предотвратява активността на RNase ензимите и DNase ензимите чрез денатуриране. В противен случай тези ензими биха увредили екстракта (РНК или ДНК).
Какво представлява гуанидин хидрохлорид?
Гуанидин хидрохлорид (GdnHCl) е по-слаб протеинов денатурант, който се използва по-рядко при изолиране на РНК. Известен е още като гуанидиниев хлорид (GdmCl). Това е хидрохлоридната сол на гуанидина. Гуанидин хидрохлоридът е хаотропен и един от денатурантите, използвани във физикохимичните изследвания на сгъването на протеини.
Фигура 01: Гуанидин хидрохлорид
Гуанидин хидрохлорид също има способността да намалява ензимната активност и да повишава разтворимостта на хидрофобните молекули. Обикновено при по-високи концентрации на гуанидин хидрохлорид протеините губят своята подредена структура. Протеините са склонни да се навиват произволно при тази концентрация на гуанидин хидрохлорид. В медицински или болнични условия гуанидин хидрохлоридът е показан за намаляване на симптомите на мускулна слабост и лесна умора, свързани със синдрома на Eaton-Lambert. Освен това страничните ефекти от употребата на гуанидин хидрохлорид могат да включват перисталтика, диария и фатално потискане на костния мозък.
Какви са приликите между гуанидин тиоцианат и гуанидин хидрохлорид?
- Гуанидин тиоцианат и гуанидин хидрохлорид са два различни вида протеинови денатуранти.
- И двата денатуранта имат гуанидин в структурата си.
- Те са хаотропни агенти.
- И двата денатуранта могат да се използват за изолиране на РНК.
- И двете се използват в медицински или болнични условия.
Каква е разликата между гуанидин тиоцианат и гуанидин хидрохлорид?
Гуанидин тиоцианатът е по-силен протеинов денатурант, който се използва по-често при изолиране на РНК, докато гуанидин хидрохлоридът е по-слаб протеинов денатурант, който се използва по-рядко при изолиране на РНК. По този начин, това е ключовата разлика между гуанидин тиоцианат и гуанидин хидрохлорид. Освен това химичната формула на гуанидин тиоцианат е C2H6N4S, докато химичната формула на гуанидин хидрохлорид е CH5N3HCl.
Инфографиката по-долу представя разликите между гуанидин тиоцианат и гуанидин хидрохлорид в таблична форма за едно до друго сравнение.
Резюме – гуанидин тиоцианат срещу гуанидин хидрохлорид
Гуанидин тиоцианат и гуанидин хидрохлорид са два различни вида протеинови денатуранти. И двата денатуранта са хаотропи. Гуанидин тиоцианатът е по-силен протеинов денатурант, който се използва по-често при изолирането на РНК, докато гуанидин хидрохлоридът е по-слаб протеинов денатурант, който се използва по-рядко при изолирането на РНК. И така, това обобщава разликата между гуанидин тиоцианат и гуанидин хидрохлорид.
