Ключовата разлика между електрофорезата с агарозен и полиакриламиден гел е, че електрофорезата с агарозен гел използва хоризонтално излети агарозни гелове за разделяне на сравнително по-големи фрагменти от ДНК, докато електрофорезата с полиакриламиден гел използва вертикално излети полиакриламидни гелове за разделяне на по-къси фрагменти от нуклеинова киселина.
Електрофорезата е вид техника, която използва електрическо поле, приложено върху гел матрица за разделяне на биомолекули като ДНК, РНК и протеини. Това разделяне на биомолекули като ДНК, РНК и протеини чрез електрофореза се основава на заряд и размер. Пробите се зареждат в ямките на гела. По-късно електрическото поле се прилага върху гела. Полето кара отрицателно заредените молекули да се движат към положителния електрод. Матрицата на гела действа като молекулярно сито, през което най-малките молекули преминават или пътуват бързо, докато по-големите молекули се движат бавно. Това позволява разделянето на молекулите въз основа на заряд и размер. Следователно електрофорезата с агарозен и полиакриламиден гел са два вида техники за електрофореза с гел, които основно помагат за разделянето на молекулите въз основа на техния размер и заряд.
Какво е електрофореза с агарозен гел?
Агарозна гел електрофореза е техника, която използва агарозни гелове за отделяне на биомолекули като ДНК и РНК. Това е техника, използвана за разделяне на нуклеинови киселини предимно по размер. Основното съединение, наречено агароза, използвано в тази техника, е полизахарид. Произлиза от морски водорасли. Агарозата може да се разтвори във врящ буфер и след това да се изсипе в тава, която се държи хоризонтално. В тавата се втвърдява като изстине и се оформя на блат. Агарозните гелове се изсипват с гребен на място, за да се направят ямки, в които се зареждат нуклеинови киселини като ДНК или РНК, след като гелът се втвърди.
Фигура 01: Електрофореза с агарозен гел
По-късно гелът се потапя в подходящ буфер и през гела се прилага ток. ДНК има равномерен отрицателен заряд, който не зависи от състава на последователността на молекулата. Следователно ДНК молекулите ще мигрират от катода (-) към анода (+). Скоростта на миграция е в пряка зависимост от размера на молекулата. Най-големите макромолекули имат най-трудното навигиране през гела. От друга страна, по-малките макромолекули преминават през гела бързо и доста лесно.
Какво е електрофореза с полиакриламиден гел?
Електрофореза с полиакриламиден гел (PAGE) е техника, която използва полиакриламидни гелове за отделяне на биомолекули. Това е техника, която се използва широко за разделяне на биологични макромолекули, обикновено протеини и нуклеинови киселини, според тяхната електрофоретична подвижност. Хидратирането на акрилонитрил води до образуването на акриламидни молекули от нитрил хидратаза. Акриламидът е разтворим във вода и при добавяне на инициатори на свободни радикали, акриламидът полимеризира, което води до образуването на полиакриламиден гел. Обикновено повишените концентрации на акриламид водят до намален размер на порите в гела. Полиакриламидните гелове се изсипват вертикално, за разлика от агарозните гелове.
Фигура 02: Електрофореза с полиакриламиден гел
При електрофорезата с полиакриламиден гел молекулите могат да работят в естественото си състояние, запазвайки структурата на молекулите от по-висок ред. Този метод се нарича native PAGE. Като алтернатива може да се добави химически денатурант, за да се премахне структурата от по-висок ред и да се превърне молекулата в неструктурирана молекула, чиято подвижност зависи само от нейната дължина. Този тип се нарича SDS-PAGE.
Какви са приликите между електрофорезата в агароза и полиакриламиден гел?
- Електрофореза с агарозен и полиакриламиден гел са два вида техники за електрофореза с гел.
- Всъщност това са молекулярно-биологични техники.
- И двете техники се използват за откриване на биологични макромолекули като ДНК и протеини.
- Тези техники се извършват от квалифицирани техници или изследователи.
- И в двете техники разделянето на макромолекулите се основава на заряда и размера.
- И двете техники позволяват разделянето на нуклеинови киселини като ДНК и РНК.
Каква е разликата между електрофорезата с агарозен и полиакриламиден гел?
Електрофореза с агарозен гел е техника, която използва хоризонтално излети агарозни гелове за отделяне на биомолекули, докато електрофорезата с полиакриламиден гел е техника, която използва вертикално излети полиакриламидни гелове за отделяне на биомолекули. Това е ключовата разлика между електрофорезата в агарозен и полиакриламиден гел. Освен това електрофорезата в агарозен гел се използва за разделяне на ДНК и РНК, докато електрофорезата в полиакриламиден гел се използва за разделяне на нуклеинови киселини като ДНК, РНК или протеини.
Следващата таблица обобщава разликата между електрофореза с агарозен и полиакриламиден гел.
Обобщение – Електрофореза с агароза срещу полиакриламиден гел
Електрофореза с агарозен и полиакриламиден гел са два вида техники за електрофореза с гел, използвани в лабораториите по молекулярна биология. Електрофореза с агарозен гел използва агарозен гел за отделяне на биомолекули. Агарозата обикновено не е токсична за хората, докато полиакриламидът е токсичен за хората. Освен това електрофорезата с агарозен гел показва ниска разделителна способност, докато електрофорезата с полиакриламиден гел показва по-висока разделителна способност. Електрофореза с полиакриламиден гел използва полиакриламиден гел за отделяне на биомолекули. Това обобщава разликата между електрофореза с агарозен и полиакриламиден гел
