Ключовата разлика между протеинова субединица и домейн е, че протеиновата субединица е отделна полипептидна верига от протеин, която се сглобява с други полипептидни вериги, за да образува протеинов комплекс, докато протеиновият домейн е съседна област на полипептидната верига на протеин, който често се сгъва независимо в компактна, локална и полунезависима единица.
Протеиновата субединица и домейн са много важни части от мултимерния протеин. Протеините са полимери, направени от полипептиди. Всяка полипептидна верига се изгражда от мономер, известен като аминокиселина. Сложният протеин съдържа различни структурни единици като субединици, домейни, мотив и гънка. Тези структурни единици на комплексния протеин са изключително важни за неговата структура и в крайна сметка за неговата функция.
Какво е протеинова субединица?
Протеиновата субединица е отделна полипептидна верига на протеин, която се сглобява с други полипептидни вериги, за да образува протеинов комплекс. В структурната биология протеиновата субединица е единична протеинова молекула, която се сглобява заедно с други протеинови молекули, за да образува протеинов комплекс. Естествено срещащите се протеини имат относително малък брой субединици, като хемоглобин и ДНК полимераза. Поради това те се наричат олигомерни. Други протеини се състоят от голям брой субединици, така че те се описват като мултимерни. Например, микротубулите и други протеини на цитоскелета са мултимерни. Подединиците на мултимерния протеин могат да бъдат идентични (хомоложни) или напълно различни (хетероложни).
Фигура 01: Протеинова субединица
В някои мултимерни протеини една субединица може да бъде каталитична субединица. От друга страна, другият е регулаторна подединица. Функцията на каталитичната субединица е катализиране на ензимната реакция, докато функцията на регулаторната субединица е улесняване или инхибиране на нейната активност. Ензим, който се състои както от каталитични, така и от регулаторни субединици, когато е сглобен, обикновено се нарича холоензим. Например, ензимът клас I фосфоинозитид 3-киназа има р110 каталитична субединица и р85 регулаторна субединица. Освен това, протеинът трябва да има един ген за всяка субединица. Това е така, защото субединицата е изградена от отделна полипептидна верига, която има един кодиращ ген.
Какво е протеинов домейн?
Протеинов домен е съседна област от полипептидната верига на протеин, която често се нагъва независимо в компактни, локални и полунезависими единици. Домейнът на протеин е известен също като регион на полипептидната верига на протеин, който се самостабилизира и сгъва независимо от останалите. Те са отделна структурна и функционална единица в протеина. Обикновено домейните са отговорни за специфична функция или взаимодействие, което допринася за цялостната роля на протеина. Например, домейнът SH3 е около 50 аминокиселинни остатъка. Те се срещат в разнообразен набор от протеини, включително адапторни протеини, фосфатидилинозитол3-кинази, фосфолипази и миозини. Тези SH3 домейни участват във взаимодействията протеин-протеин.
Фигура 02: Протеинови домейни
Домейните са с различна дължина от 50 аминокиселини до 250 аминокиселини. Най-късите домени, като например цинков пръст, са стабилизирани от метални йони и дисулфидни мостове. Домейнът често произвежда функционални единици като калциево-свързващия EF-ръчен домейн на калмодулин. Освен това домейните могат да бъдат разменени чрез генно инженерство между един протеин в друг, за да се направят химерни протеини.
Какви са приликите между протеинова субединица и домейн?
- Протеиновата субединица и домейн са структурни единици на мултимерен протеин.
- И двете са изградени от аминокиселини.
- Те са свързани с термина “полипептидна верига”.
- Освен това и двете са изключително важни за цялостната функция на протеина.
Каква е разликата между протеинова субединица и домейн?
Протеиновата субединица е отделна полипептидна верига на протеин, която се сглобява с други полипептидни вериги, за да образува протеинов комплекс. От друга страна, протеиновият домейн е съседен регион на полипептидната верига на протеин, който често се нагъва независимо в компактни, локални и полунезависими единици. И така, това е ключовата разлика между протеинова субединица и домейн. Освен това протеиновата субединица е по-голяма по размер от протеиновия домейн.
Следващата таблица обобщава разликата между протеинова субединица и домейн в таблична форма.
Обобщение – Протеинова субединица срещу домейн
Градивните елементи на протеините са аминокиселини. Протеините се образуват чрез кондензация на аминокиселини. Белтъчните структури варират по размер от десетки до няколко хиляди аминокиселини. Протеиновата структура се стабилизира чрез нековалентни взаимодействия като водородни връзки, йонни връзки, сили на Ван дер Ваалс, хидрофобни връзки и ковалентни взаимодействия като дисулфидни връзки. Сложният протеин съдържа различни структурни единици като субединици, домейни, мотив и гънка. Протеиновата субединица е отделна полипептидна верига на протеин, която се сглобява с други полипептидни вериги, за да образува протеинов комплекс. От друга страна, протеиновият домейн е област от полипептидната верига на протеина, която се самостабилизира и сгъва независимо от останалите. Така това е обобщението на разликата между протеинова субединица и домейн.
