Ключовата разлика между мотив и домейн е, че мотивът не е независимо стабилен, докато домейнът е независимо стабилен.
Протеините са важни биологични макромолекули, присъстващи в нашето тяло. От друга страна, генетичният код на ген ще определи аминокиселинната последователност на протеина. Освен това протеините имат първична, вторична и третична структура. Първичната структура е аминокиселинната последователност на полипептидната верига. Когато полипептидните вериги се сгъват една с друга, това образува вторичната структура на протеина. Алфа спиралите, бета листовете и супервторичните структури принадлежат към вторичните структури. Определени групи от свръхвторични елементи са известни като протеинови мотиви. Третичната структура на протеина се отнася до неговата триизмерна структура, която определя функцията на протеина. Домейнът е нагъната част от протеинова молекула, която е глобуларна и има дискретна функция. Това е основната функционална и триизмерна структура на протеина.
Какво е мотив?
Мотивът е определено групиране на супервторични елементи на протеини като алфа спирали и бета структури. Те са някакъв вид модели, присъстващи в различни протеини. Мотивите описват моделите на сгъване на вторичните структурни елементи и техните взаимодействия. Тези модели на сгъване се стабилизират чрез подобни връзки, които присъстват в третичните структури. Те обаче не са толкова сложни, колкото третичните структури.
Фигура 01: Мотив
Те са прости комбинации от вторични структури на протеини. Мотивът не е стабилен сам по себе си. Освен това мотивите обясняват структурата на протеина, но не предсказват функцията на протеина. Примери за протеинови мотиви са бета-алфа-бета мотив, гръцки ключов мотив, бета варел, бета-меандър мотив и др.
Какво е домейн?
Доменът е фундаментална, функционална и триизмерна единица на протеин. Той изпълнява определена функция. Един протеин може да има няколко различни домена. Всеки домейн е независима единица. Това е кълбовидна структура. Той отговаря за специфична функция или взаимодействие. Домейните могат да се използват за хипотеза за функцията на нехарактеризиран протеин. Когато анализирате протеин, е важно да се вземе предвид, тъй като домейните са функционалните единици на протеина.
Фигура 02: Три различни домена на пируват киназа
Домеите са много стабилни и компактни структури. Те могат лесно да бъдат разграничени от други региони. Пируват киназата има три различни домена, както е показано на фигура 02. Дължината на домейна може да варира и средната дължина е 100 аминокиселини. Всеки домейн съдържа хидрофобно ядро, изградено от вторични структурни единици. Няколко домейна заедно съставляват третичната структура на протеина.
Какви са приликите между мотив и домейн?
- Мотивът и домейнът са единици, присъстващи в самите протеинови молекули.
- Полезни са при класифициране на протеинови семейства.
Каква е разликата между мотив и домейн?
Мотивът е определено групиране на супервторични елементи на протеини като алфа спирали и бета структури, докато домейнът е функционалната единица на протеин. Освен това, мотивът е вторична структура, докато домейнът е отговорен за третичната структура на протеина. Освен това домейнът е независима единица, за разлика от мотива. Освен това домейнът изобразява функцията на протеин, докато мотивът не е. Това са основните разлики между мотив и домейн. Инфографиката по-долу представя разликата между мотив и домейн в таблична форма.
Резюме – мотив срещу домейн
Мотивът е подреждане на вторични структури на протеиновата молекула. Обикновено не е стабилен сам по себе си, за разлика от домейна. Доменът е независима стабилна структура на протеин. Следователно, той може да бъде част или цяла протеинова молекула. Това е триизмерна фундаментална функционална единица на протеина. Освен това има функция и е независима единица. Мотивът може да бъде част от домейна. Но домейнът не може да бъде част от мотив. Това е разликата между motiv и домейн.
