Ключовата разлика между CRISPR и CRISPR Cas9 е, че CRISPR (клъстерно редовно разпределено кратко палиндромно повторение) е естествен прокариотен имунен защитен механизъм, докато CRISPR cas9 е РНК-насочвана Cas9 нуклеаза, която е част от CRISPR адаптивен имунна система.
CRISPR е антивирусна защитна имунна система, открита в бактерии и археи. Това е семейство от ДНК последователности, открити в бактериалния геном. Състои се от спейсерни последователности, които са получени от ДНК фрагменти на бактериофаги, които преди това са ги заразили. При последващи вирусни инфекции бактериите използват тези последователности, за да унищожат вирусната ДНК. CRISPR последователностите имат къси палиндромни повторения и спейсър последователности. Освен това CRISPR повтарящите се спейсър последователности често имат свързани гени, които кодират Cas протеини. Cas9 е РНК направлявана ендонуклеаза. Заедно с CRISPR последователностите, протеинът Cas9 действа като адаптивна имунна система в бактериите срещу бактериофагите.
Какво е CRISPR?
CRISPR означава Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. Това е клъстер от ДНК последователности, открити в бактериалния геном. Той действа като естествен защитен механизъм в бактериите и за първи път е идентифициран в E. coli. При бактериите той действа като адаптивна имунна защита, особено срещу бактериофаги. Следователно това е механизъм, специфичен за последователността.
Фигура 01: CRISPR
Системата CRISPR съдържа няколко къси сегментирани ДНК повторяеми последователности. Тези повторения са палиндромни, имат една и съща основна последователност при четене от 5' до 3', докато другото дава същата последователност при четене от 3' до 5'. Освен това повторенията са идентични. Те са разположени между къси „спейсърни“ДНК последователности, които не са идентични. Но тези разделителни ДНК последователности са подобни или съвпадащи с ДНК на чужд бактериофаг. Гените, свързани с CRISPR, са известни като CRISPR свързани гени или Cas гени. Cas гените кодират Cas протеини, които са хеликази или нуклеази. Хеликазите размотават ДНК, докато нуклеазите разрязват ДНК. Като цяло, когато разглеждаме CRISPR, това е имунна система от бактерии, която работи срещу бактериофаги (бактерии, заразяващи вируси).
Какво е CRISPR Cas9?
Cas9 или свързаният с CRISPR протеин 9 е бактериална РНК-насочвана ендонуклеаза. Следователно това е ензим, който разпознава и разрязва целевата ДНК (особено ДНК на бактериофага), комплементарна на водещата РНК. Той извършва специфично за веригата разцепване. Cas9 протеинът е кодиран от CRISPR свързан ген. CRISPR cas9 е РНК-насочвана CRISPR-Cas9 нуклеазна система, която може да се използва като РНК-програмируема платформа за насочване и редактиране на ДНК за редактиране на генома, транскрипционни смущения, епигенетична модулация и изобразяване на генома. Тази система CRISPR cas9 е много популярна в настоящите системи за редактиране на генома.
Фигура 02: CRISPR Cas9
Понастоящем системата CRISPR/Cas9 се използва за промяна или модифициране на генома на бозайник чрез потискане или активиране на транскрипция. Клетките на бозайниците могат да реагират на медиирани от CRISPR/Cas9 разкъсвания на ДНК чрез възприемане на механизъм за възстановяване. Може да се извърши или с помощта на метода на нехомоложно свързване на краищата (NHEJ) или чрез ремонт, насочен към хомология (HDR). И двата механизма за възстановяване се осъществяват чрез въвеждане на двуверижни прекъсвания. Това води до редактиране на гени на бозайници. NHEJ може да доведе до аблация на генни мутации и може да се използва за създаване на ефекти на загуба на функция. HDR може да се използва за въвеждане на специфични точкови мутации или въвеждане на ДНК сегменти с различна дължина. Понастоящем системата CRISPR/Cas се използва в областта на терапевтичните, биомедицинските, селскостопанските и изследователските приложения.
Какви са приликите между CRISPR и CRISPR Cas9?
- Cas9 е част от системата CRISPR Cas.
- Crisper cas9 system е имунна система, естествено открита в бактерии.
Каква е разликата между CRISPR и CRISPR Cas9?
CRISPR е клъстер от ДНК последователности, открити в бактериалния геном, който работи като естествена защитна система срещу бактериофаги. Състои се от редовно разположени къси палиндромни повторения, разделители и свързани гени. Обратно, cas9 е протеин 9, свързан с CRISPR, който е РНК ръководен ендонуклеазен ензим. Той разпознава и разцепва ДНК двойни вериги на вируси. Всъщност това е част от защитната система CRISPR. И така, това е ключовата разлика между CRISPR и CRISPR cas9.
Резюме – CRISPR срещу CRISPR Cas9
CRISPR Cas системата е система за микробна защита. CRISPR е клъстер от ДНК последователности, съставен от палиндромни къси повторения, спейсерни последователности и свързани гени. Cas9 е един Cas протеин, който е РНК направлявана ендонуклеаза. CRISPR и протеинът Cas9 създават имунна система, която работи срещу бактериофагни инфекции в бактериите. Протеинът Cas9 е в състояние да разцепи чужда вирусна ДНК и да ги разруши. CrRNA насочва cas9 да разпознава вирусна ДНК. Следователно системата CRISPR cas9 е естествена имунна система, намираща се в бактерии срещу вируси. По този начин, това е обобщението на разликата между CRISPR и CRISPR cas9.
