Ключовата разлика между ДНК и РНК сондите е, че ДНК пробите са фрагменти от ДНК, които са комплементарни на целевите нуклеотидни последователности, докато РНК сондите са участъци от едноверижна РНК, които са комплементарни последователности на нуклеинова киселина на целевите последователности.
Сондата е изкуствено синтезирана къса последователност от ДНК или РНК, която може да бъде белязана радиоактивно или с нерадиоактивни молекули. Може да има дължина от 100 до 1000 бази. Сондите са полезни при откриване на целеви нуклеотидни последователности, които са комплементарни на последователността на сондата. Веднъж добавени, сондите се хибридизират с комплементарните последователности или целевите последователности и ги правят видими за идентифициране на целевите последователности, тъй като носят радиоактивност. Сондите са важни молекулярни инструменти за много микробни и молекулярни области като откриване на генетични заболявания, във вирусологията, в съдебната патология, в тестовете за бащинство, в ДНК пръстови отпечатъци, RFLP, молекулярна цитогенетика, in situ хибридизация и др.
Какво представляват ДНК сондите?
ДНК сондите са едноверижни участъци от ДНК. Те могат да се използват за откриване на наличието на комплементарни последователности на нуклеинова киселина (целеви последователности) чрез хибридизация. След като ДНК сондата се хибридизира със своята комплементарна последователност, тя образува двойноверижен хибрид. За да ги открият, ДНК сондите обикновено се маркират с радиоизотопи, биотин, епитопи или флуорофори. ДНК сондите, белязани с биотин, могат да бъдат открити с белязана със стрептавидин алкална фосфатаза чрез редица ензимни и химични методи.
Фигура 01: ДНК сонда
Нуклеотидната последователност на ДНК сондата е известна. Те са къси последователности с дължина от 100 до 1000 базови двойки. Дългите ДНК сонди могат да бъдат генерирани чрез рекомбинантна ДНК технология. Те могат също да бъдат генерирани чрез PCR и клониране. В лабораториите по клинична микробиология ДНК сондите са лесно достъпни за бърза диагностика на инфекциозни заболявания.
Какво представляват РНК сонди?
РНК сондите са едноверижни участъци от РНК. Те са комплементарни последователности към целевите последователности в пробата. Те обикновено се синтезират с РНК полимерази от бактериофаги SP6, T7 или T3 чрез in vitro транскрипция на ДНК. Дълги РНК проби могат да бъдат генерирани чрез in vitro транскрипция от линеаризирана плазмидна ДНК. Като цяло, РНК сондите се свързват силно и по-здраво с техните комплементарни последователности, отколкото ДНК сондите. Подобно на ДНК сондите, РНК сондите също могат да бъдат белязани, докато се транскрибират.
Какви са приликите между ДНК и РНК сондите?
- Както ДНК, така и РНК сондите са едноверижни нуклеотидни последователности.
- И двете са изкуствено проектирани и синтезирани.
- Освен това, те могат да бъдат маркирани с радиоизотопи, епитопи, биотин или флуорофори.
- Те имат силен афинитет към специфична ДНК или РНК целева последователност.
- Използват се в различни техники за блотинг и in situ хибридизация за откриване на целеви последователности на нуклеинова киселина.
- И двата вида сонди могат да бъдат хибридизирани с техните комплементарни последователности.
- Използват се и при идентифициране на микроорганизми и диагностика на инфекциозни, наследствени и други заболявания.
Каква е разликата между ДНК и РНК сонди?
ДНК сондата е къс участък от ДНК, който е комплементарен на целевата последователност. От друга страна, РНК сондата е къс едноверижен участък от РНК, комплементарна на целевата последователност. По този начин, това е ключовата разлика между ДНК и РНК сонди. Освен това, ДНК сондите съдържат A, T, C и G, докато РНК пробите съдържат A, U, C и G.
Освен това, допълнителна разлика между ДНК и РНК сондите е тяхната термодинамична стабилност. РНК сондите показват по-голяма термодинамична стабилност в сравнение с ДНК сондите.
По-долу инфографиката представя в таблица важните разлики между ДНК и РНК проби.
Резюме – ДНК срещу РНК сонди
Сондата е малък фрагмент от ДНК или РНК, използван за откриване на наличието на специфична последователност в пробата от ДНК или РНК чрез молекулярна хибридизация. ДНК сондите са къси едноверижни ДНК фрагменти, докато РНК сондите са къси едноверижни РНК последователности. Те са известни последователности. Термодинамичната стабилност е по-голяма в РНК сондите, отколкото в ДНК сондите. РНК сондите се свързват здраво с техните комплементарни последователности, отколкото ДНК сондите се свързват. Така това обобщава разликата между ДНК и РНК сонди.
