Ключовата разлика между интроните от група I и група II е, че в интроните от група I реакцията на снаждане се инициира от гуанозин кофактор, докато в интроните от група II реакцията на снаждане се инициира от вътрешен аденозин.йени
Pre-mRNA е първичният транскрипт, който има както интрони, така и екзони. Пре-иРНК трябва да се преобразува в иРНК преди транслацията. РНК сплайсинг или пре-иРНК сплайсинг е една такава пост-транскрипционна модификация. При сплайсинг на РНК интроните се отстраняват от молекулата на пре-иРНК и екзоните се свързват заедно. Интроните от група I и група II са самосплайсиращи се интрони. Те се отделят от пре-иРНК молекулата без помощта на друг ензим. Следователно те са РНК ензими или рибозими, които катализират собствения си сплайсинг от пре-иРНК. Освен това те имат способността да функционират като мобилни елементи. По време на сплайсинга протичат серия от реакции на транс-естерификация, за да се изреже интрона и да се лигират екзоните. Тези рибозими присъстват и в трите домейна, включително бактерии, археи и еукариоти.
Какво представляват интроните от група I?
Интроните от група I са вид самосплайсиращи се рибозими, открити в бактерии, бактериофаги и еукариоти (органеларни и ядрени геноми). Те се намират в основните гени. Те са в състояние да катализират собствения си сплайсинг от пре-mRNA молекулата. Интроните от група I могат да имат няколкостотин до три хиляди нуклеотида. Освен това, те показват малко сходство на последователностите между организмите.
Фигура 01: Интрони от група I
Вторичните структури са силно запазени в четири къси региона. Има два етапа на реакция на трансестерификация на снаждане. Интроните от група I инициират сплайсинг механизъм чрез нуклеофилна атака на 3' хидроксил на гуанозин кофактор в 5P мястото на снаждане.
Какво представляват интроните от група II?
Интроните от група II са вид самосплайсиращи се интрони, открити в организми, принадлежащи към трите домена. Те са рибозими, които катализират собствените си реакции на снаждане от пре-иРНК. Те се намират в rRNA, tRNA и гени, кодиращи протеини. Но те не се намират в ядрените геноми, за разлика от интроните от група I.
Фигура 02: Интрони от група II
Интроните от група II катализират сплайсинга чрез два етапа на трансестерификация, подобно на интроните от група I. Тези ензими инициират реакцията на сплайсинг чрез нуклеофилната атака на 2' OH на аденозина на мястото на разклоняване на 5' снаждащата връзка. По време на реакции на снаждане, интроните от група II образуват структура, подобна на лариат. Освен това, интронното снаждане се извършва в отсъствието на GTP.
Какви са приликите между интроните от група I и група II?
- Интроните от група I и група II са два вида РНК ензими, рибозими, които катализират собствения си сплайсинг чрез различни механизми.
- Те са големи рибозими.
- И двете се намират и в трите домейна.
- Те са мобилни елементи.
- Освен това, те се намират в rRNA, tRNA и гени, кодиращи протеини.
- И двата ензима се използват като инструменти в биотехнологиите и молекулярната медицина за насочени нокаут/унищожаване на гени, доставяне на гени или системи за генна терапия.
Каква е разликата между интроните от група I и група II?
Интроните от група I са рибозими, открити в бактерии, бактериофаги и еукариотни органеларни и ядрени геноми. Интроните от група II са рибозими, открити в бактерии, археи и еукариотни органели. Освен това, интроните от група I инициират реакция на сплайсинг чрез нуклеофилната атака на 3' хидроксил на гуанозинов кофактор в мястото на снаждане 5P, докато интроните от група II инициират реакция на снаждане чрез нуклеофилната атака на 2' OH на аденозина на мястото на разклоняване на 5′ снаждане. И така, това е ключовата разлика между интроните от група I и група II.
Освен това, интроните от група II образуват подобна на лариат структура по време на сплайсинга, докато интроните от група I не се образуват. По този начин, това е друга значителна разлика между интроните от група I и група II. Освен това, интроните от група I се намират в еукариотните ядрени геноми, докато интроните от група II не се намират в еукариотните ядрени геноми.
По-долу инфографиката изброява разликите между интроните от група I и група II в таблична форма за сравнение едно до друго.
Резюме – Интрони от група I срещу група II
Интроните от група I и II са големи рибозими, които катализират реакция на трансестерификация за отделяне на интрони от първичния транскрипт. Те се намират и в трите домейна. И двамата са мобилни генетични елементи. Освен това те се използват като инструменти в биотехнологиите и молекулярната медицина. Въпреки това, интроните от група I инициират реакция на снаждане чрез нуклеофилната атака на 3' OH на гуанозин кофактор в мястото на 5P снаждане. Но интроните от група II инициират реакция на сплайсинг чрез нуклеофилната атака на 2' OH на аденозина на мястото на разклоняване на 5' сплайсинг съединението. Освен това, интроните от група II образуват структура, подобна на лариат, по време на сплайсинга, докато интроните от група I не образуват структура, подобна на лариат. Така това е обобщението на разликата между интроните от група I и група II.
