Ключовата разлика между MLVA и MLST е, че MLVA използва полиморфизма на тандемно повтарящи се ДНК последователности, за да характеризира микробните видове, докато MLST използва полиморфизма на ДНК последователностите на вътрешните фрагменти на множество домакински гени, за да характеризира микробните видове.
Микробното типизиране обикновено се използва за определяне на източника и пътищата на инфекциите. Потвърждава или отхвърля огнища. Микробното типизиране също така проследява кръстосаното предаване на патогени, свързани със здравеопазването, и разпознава вирулентни щамове. Освен това микробното типизиране оценява ефективността на мерките за контрол на патогенните микробни видове. MLVA и MLST са две молекулярно-биологични техники, използвани при микробно типизиране.
Какво е MLVA?
Multiple loci VNTR анализ (MLVA) е молекулярно-биологичен метод, който използва полиморфизма на тандемно повтарящи се ДНК последователности за характеризиране на микробни видове. Това е метод, използван за генетичен анализ на определени микробни видове.
По време на първата стъпка на MLVA, всеки целеви VNTR локус се амплифицира чрез PCR със странични праймери, специфични за региона. След това получените фрагменти се разделят по размер чрез електрофореза на капилярен секвенатор. Генотипирането на всеки локус и резултатите, събрани от всяка проба, позволяват характеризиране на микроорганизъм, чийто вид е известен. Той също така позволява идентифициране на подвида чрез въвеждане на алели и сравнение с базите данни на MLVA.
Фигура 01: MLVA
Този метод MLVA е по-селективен от метода MLST. Освен това, методът MLVA не изисква стъпка на секвениране на ДНК. По този начин прави възможно диференцирането на близки подвидове или клонови видове.
Какво е MLST?
Мултилокусно типизиране на последователности (MLST) е техника, която използва полиморфизма на ДНК последователности на вътрешни фрагменти на множество домакински гени, за да характеризира микробните видове. MLST е техника в генетичния анализ за типизиране на множество локуси.
Фигура 02: MLST
Това е вид типизиране на последователността, използвано като референтна техника за разграничаване на различни щамове на микробни видове. Този метод се основава на секвениране на гени за домакинство. Гените за домакинство обикновено кодират основни протеини на микробни агенти като бактерия. Тези последователности от домакински гени имат особеността да представят стабилен полиморфизъм във времето. Следователно разликите в последователностите на домакинските гени са достатъчни, за да се разграничат щамовете един от друг. Освен това, първата разработена MLST схема е Neisseria meningitidis, причинителят на менингококов менингит и септицемия. От въвеждането си MLST се използва не само за човешки патогени, но и за растителни патогени.
Какви са приликите между MLVA и MLST?
- MLVA и MLST са две молекулярно-биологични техники, използвани при микробно типизиране.
- И двете техники могат да се използват за микробен филогенетичен анализ.
- И двете техники се основават на генетичен полиморфизъм.
- Могат да се използват за откриване на човешки заболявания, причиняващи микробни патогени.
- И двете техники трябва да се извършват от квалифицирани молекулярни биолози.
Каква е разликата между MLVA и MLST?
MLVA е техника, която използва полиморфизма на тандемно повтарящи се ДНК последователности за характеризиране на микробни видове. Междувременно MLST е техника, която използва полиморфизма на ДНК последователности на вътрешни фрагменти на множество домакински гени, за да характеризира микробните видове. По този начин това е ключовата разлика между MLVA и MLST. Освен това методът MLVA е по-селективен от метода MLST.
Инфографиката по-долу представя разликите между MLVA и MLST в таблична форма за паралелно сравнение.
Резюме – MLVA срещу MLST
MLVA и MLST са две молекулярно-биологични техники, използвани при микробно типизиране. MLVA използва полиморфизма на тандемно повтарящи се ДНК последователности, за да характеризира микробните видове, докато MLST използва полиморфизма на ДНК последователностите на вътрешните фрагменти на множество домакински гени, за да характеризира микробните видове. И така, това е ключовата разлика между MLVA и MLST.
