Ключовата разлика между Cosmid и Phagemid е в типа последователности, които съдържа. Космидът съдържа cos място и плазмид. Следователно, това е хибриден вектор, докато Phagemid е плазмид, който съдържа F1 източник на репликация на F1 фага.
Cosmids и Phagemids се използват за целите на клонирането, особено за клониране на по-големи фрагменти от ДНК. Те се използват широко, особено при клониране на гени, отговорни за производството на различни протеини. Космидите и фагемидите или се репликират самостоятелно като плазмиди, или се пакетират във вирусни частици и след това се репликират.
Какво е космид?
A Cosmid, наричан хибриден плазмид, включва cos сайтове, извлечени от Lambda фагови частици и плазмид. Тези cos места са дълги фрагменти от ДНК с 200 базови двойки. Следователно те имат кохезивни или лепкави краища, които позволяват на плазмида да се побере във вирусната ДНК. Следователно cos местата са жизненоважни за опаковането на ДНК.
Има три cos сайта;
- cosN сайт – участва в изрязване на ДНК веригата чрез терминазна активност
- cosB сайт – ангажиран със задържането на терминаза.
- cosQ сайт – участва в предотвратяването на разграждането на ДНК от ДНК-ази.
Фигура 01: Космида
Освен това, Cosmids могат да репликират едноверижна ДНК или двойноверижна ДНК, като използват подходящ произход на репликация. Космидите обикновено съдържат гени за резистентност към антибиотици като маркери за селекция на трансформанти. По този начин използването на космид като вектор може да улесни клонирането, а рестрикционното ензимно смилане на вектора може след това да извлече тези фрагменти.
Какво е Phagemid (Phasmid)?
Phagemid, също наричан Phasmid, също е вид хибриден вектор. Phagemid съдържа специален произход на репликация, наречен f1 произход на репликация. Началото на репликацията f1 се извлича от фаг f1.
Phagemid може да репликира както едноверижна, така и двойноверижна ДНК. Репликацията може или да се осъществи като плазмид, докато се подлага на независима репликация, или може да се опакова във фагови частици и накрая да зарази бактериалния гостоприемник E coli. Когато заразява клетките на E coli, фагът f1 изисква наличието на пилус. Следователно, половите пили са важни по време на in vitro опаковането на Phagemids.
Какви са приликите между Cosmid и Phagemid?
- Както Cosmid, така и Phagemid са вектори за клониране, използвани в рекомбинантната ДНК технология.
- Cosmid и Phagemid могат да репликират едноверижна и двойноверижна ДНК.
- И двете могат да претърпят независима репликация подобно на плазмидите.
- Cosmid и Phagemid могат да бъдат подложени на in vitro опаковане и да заразят бактериални клетки.
- Както Cosmid, така и Phagemid изискват подходящ произход на репликация за клониране.
Каква е разликата между Cosmid и Phagemid?
Cosmid срещу Phagemid |
|
| Cosmid е хибриден вектор, който съдържа cos сайт и плазмид. | Phagemid е плазмид, който съдържа F1 източник на репликация на F1 фага. |
| Наличие на Cos сайтове | |
| Тъй като сайтовете присъстват в космид и са необходими за in vitro опаковане. | Тъй като сайтовете отсъстват във phagemid. |
| Наличие на F1 произход на репликация | |
| В космид, fi произходът на репликацията може да присъства или да не присъства. | F1 произходът на репликацията присъства във фагемид. |
| Наличие на резистентни към антибиотици гени | |
| Устойчиви на антибиотици гени присъстват в козмидите за идентифициране на трансформантите от нетрансформантите. | Гени, устойчиви на антибиотици, липсват във фагемидите. |
| Изискване за ин витро опаковане | |
| Изисква cos сайт. | Изисква секс пилус. |
Резюме – Cosmid срещу Phagemid
Cosmid и Phagemid са вектори за клониране, използвани в рекомбинантната ДНК технология. Космидите са хибридни вектори, които съдържат специални лепкави краища, известни като cos сайтове. in-vitro опаковките изискват тези cos сайтове. Докато фагемидите са плазмиди, които съдържат f1 начало на репликация, извлечено от f1 фаг. Както козмидът, така и фагемидът могат да претърпят независима репликация или in vitro опаковане в бактериални клетки. Това са важните разлики между космид и фагемид.
