Ключовата разлика между snRNA и snoRNA е, че snRNA включва алтернативно снаждане на пре-mRNA, докато snoRNA включва модифициране на rRNA и tRNA, редактиране на mRNA и отпечатване на генома.
Малките РНК са полимерни РНК молекули, които се състоят от по-малко от 200 нуклеотида. Те обикновено не са кодиращи. Те съществуват сред информационните РНК, за да пренасят сигнали. Малките РНК произхождат от перфектна двойноверижна РНК, която се произвежда от действието на РНК-зависима РНК полимераза. Малките РНК играят важна роля в клетъчната диференциация, растеж и пролиферация, апоптоза, метаболизъм, миграция и защита. Следователно малките РНК са важни и критични регулатори на развитието и физиологията. Малката ядрена РНК и малката ядрена РНК са два класа малки РНК молекули.
Какво е snRNA?
Малката ядрена РНК или snRNA е клас малки РНК молекули, намиращи се в ядрото на еукариотните клетки. Средната дължина на snRNA е приблизително 150 нуклеотида. РНК полимераза II или РНК полимераза III транскрибира snRNA. Основната функция на snRNA е обработката на пре-информационната РНК в ядрото. Те също така помагат за регулиране на транскрипционните фактори или РНК полимераза II и поддържат теломерите.
Фигура 01: Механизъм на действие на малка РНК
Има два класа snRNA, базирани на общи характеристики на последователността и свързани протеинови фактори, като РНК свързващ LSm протеин. Двата класа са snRNA от клас Sm и snRNA от клас Lsm. SnRNA от клас Sm се състои от високо съдържание на уридин на U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 и U12. РНК полимераза II транскрибира snRNA от SM-клас. След транскрипцията на пре-snRNA, те обикновено получават 7-метилгуанозин 5' капачка в ядрото. След това те се изнасят в цитоплазмата през ядрените пори за по-нататъшна обработка. Lsm-клас snRNA има високо съдържание на уридин на U6 и U6atac. РНК полимераза III транскрибира snRNA от клас Lsm и не напуска ядрото. Най-често срещаните човешки snRNA компоненти са U1 сплайсозомална РНК, U2 сплайсозомална РНК, U4 сплайсозомална РНК, U5 сплайсозомална РНК и U6 сплайсозомална РНК.
Какво е snoRNA?
Малката нуклеоларна РНК или snoRNA е клас малки РНК молекули, които ръководят химичните модификации в други РНК като рибозомна РНК, трансферна РНК и малка ядрена РНК. Всяка snoRNA молекула е свързана с около четири основни протеина в РНК/протеиновия комплекс по време на процеса на модификация. SnoRNA съдържа антисенс елемент, който е около 10-20 нуклеотида. Тези бази са допълващи последователността около нуклеотидите, които са насочени към модификацията в пре-РНК молекулата.
Фигура 02: Малка нуклеоларна РНК
Има два класа snoRNA. Те са C/D box snoRNA и H/ACA box snoRNA. C/D box snoRNA е свързана с метилиране, а H/ACA box snoRNA е свързана с псевдоуридилация. Всяка молекула snoRNA действа като водач за една или две модификации в целева РНК. C/D кутия snoRNA съдържа два къси запазени мотива на последователност C и D, близо до 5' и 3' края на snoRNA, съответно. Късите участъци, състоящи се от 5 нуклеотида, са разположени нагоре по веригата на С кутията и надолу по веригата на D кутията и образуват структура на стволова кутия. Това доближава мотивите на кутията C и D до голяма близост. Структурата на стволовата кутия е важна за правилния синтез на snoRNA и нуклеоларната локализация. H/ACA box snoRNA има вторична структура, която се състои от две фиби и две едноверижни области. Това е общоизвестно като структурата фиби-панта-фиби-опашка. H/ACA box snoRNA също се състои от два запазени мотива H и ACA. И двете са разположени в едноверижни региони. Кутията H е в пантата, а ACA е в областта на опашката. Три нуклеотида образуват 3' края на последователността.
Какви са приликите между snRNA и snoRNA?
- snRNA и snoRNA са малки РНК.
- И двете присъстват в еукариотните клетки.
- И двете са некодиращи РНК молекули.
- Освен това те участват в модифицирането на РНК по време на процеса на транскрипция.
Каква е разликата между snRNA и snoRNA?
snRNA участва в алтернативно сплайсинг на пре-mRNA, докато snoRNA модифицира основно РНК молекули. По този начин, това е ключовата разлика между snRNA и snoRNA. Освен това snRNA са с дължина около 150 нуклеотида и често се откриват свързани с група протеини и комплекси, наречени малки ядрени рибонуклеопротеини. snoRNA са с дължина около 60-170 нуклеотида и се намират главно в нуклеола.
Освен това, snRNA се транскрибират или от РНК полимераза II, или от РНК полимераза III, докато snoRNA се транскрибира само от РНК полимераза II.
Инфографиката по-долу представя разликите между snRNA и snoRNA в таблична форма за сравнение едно до друго.
Обобщение – snRNA срещу snoRNA
snRNA и snoRNA са класове малки РНК молекули. snRNA участва в алтернативно сплайсинг на пре-mRNA, докато snoRNA модифицира основно РНК молекулите. По този начин, това е ключовата разлика между snRNA и snoRNA. Малките РНК са полимерни РНК молекули, които се състоят от по-малко от 200 нуклеотида на дължина и обикновено не са кодиращи. snRNA се намират в ядрото на еукариотите. snoRNA се намират в археи и еукариоти. Транскрипцията на snRNA се осъществява чрез РНК полимераза II и II, докато само РНК полимераза II участва в транскрибирането на snoRNA. И така, това обобщава разликата между snRNA и snoRNA.