Ключовата разлика между протеомиката и метаболомиката е, че протеомиката е изследване на всички протеини на даден организъм, докато метаболомиката е изследване на всички метаболити на даден организъм.
Геномиката е изследване на генетичния състав на организма. Протеомиката и метаболомиката са две омични науки, свързани с геномиката. Протеомът се отнася до всички протеини в клетка или организъм. Метаболомът, от друга страна, се отнася до всички метаболити на даден организъм. По този начин изследването на протеома е протеомиката, докато изследването на метаболома е метаболомиката. Както протеомиката, така и метаболомиката са важни при диагностиката на заболяването и при характеризирането и скрининга на организмите. Освен това и двете са свързани в много аспекти на клетъчната биология, особено в клетъчното сигнализиране, разграждането и генерирането на протеини и пост-транслационната модификация.
Какво е протеомика?
Протеомът е цялостният протеинов комплемент в клетка, тъкан или организъм. Следователно протеомиката е изследване на протеома на даден организъм. В протеомиката се анализират различни характеристики на протеините. Следователно протеомиката се фокусира главно върху структурата, ориентацията, функциите, протеиновите взаимодействия, модификациите, приложенията и значението на протеините. Ето защо в момента се провеждат много изследователски проекти в областта на протеомиката.
Първите протеомни изследвания бяха направени за идентифициране на протеиновото съдържание в Escherichia coli. Картографирането на общото протеиново съдържание се извършва с помощта на двуизмерни (2D) гелове. След успеха на този проект учените преминаха към характеризиране на общото съдържание на протеин в животни като морски свинчета и мишки. Понастоящем картирането на човешкия протеин се извършва с помощта на 2D гел електрофореза.
Има много предимства от изучаването на протеомиката, тъй като протеините са управляващите молекули на повечето активности поради свойството на протеините като катализатор. По този начин изследването на цели протеини може да предостави информация относно здравословното състояние на даден организъм. Освен това протеомиката има много приложения в анотацията на генома, идентифицирането и диагностиката на заболяването, провеждането на изследвания на протеиновата експресия по време на експерименти и протеинови модификации и изследвания на взаимодействията и др.
Фигура 01: Протеомика
Има различни техники, включени в протеомиката, включително извличане на общия протеин, разделянето им с помощта на 2D гел електрофореза, секвениране на извлечените протеини с помощта на методи като метода на секвениране на Едмънд или масспектрометрия и анализ на структурни и функционални свойства на протеина с помощта на компютърно базиран софтуер и биоинформатични инструменти.
Какво е метаболомика?
Метаболомиката е изследване на всички метаболити в клетка, тъкан или организъм. Той включва идентифициране и количествено определяне на клетъчни метаболити с помощта на различни усъвършенствани аналитични и статистически инструменти. Метаболомиката е важно изследване, тъй като разкрива информация относно метаболизма на даден организъм.
Фигура 02: Метаболомика
За изследване на субстрати и продукти от метаболитни реакции метаболомиката използва масспектрометрия като аналитична платформа. Масспектрометрията води до метаболити и техните концентрации, отразяващи действителното биохимично състояние на клетките или тъканите. Следователно метаболомиката може да се счита за най-доброто представяне на молекулярния фенотип на даден организъм. В допълнение към тях, метаболомиката може да се разглежда като разширение на протеомиката, тъй като повечето метаболити се генерират поради активността на ензими, които са протеини.
Какви са приликите между протеомиката и метаболомиката?
- Протеомиката и метаболомиката са две основни науки, свързани с геномиката.
- Метаболомиката може да се разглежда като продължение на протеомиката.
- Протеомът и метаболомът са тясно преплетени с много изследвания.
Каква е разликата между протеомиката и метаболомиката?
Протеомиката е широкомащабно изследване на протеини, включително тяхната структура и функция, в клетка или организъм. Междувременно метаболомиката е изследване на метаболитните профили в клетка, тъкан или организъм при даден набор от условия. И така, това е ключовата разлика между протеомиката и метаболомиката. Освен това, протеомиката се отнася главно до пълния набор от протеини, докато метаболомиката се отнася главно до пълния набор от метаболити, включително разнообразен набор от малки молекули като пептиди, въглехидрати, липиди, нуклеозиди и катаболни продукти на екзогенни съединения и др. Следователно това е друга разлика между протеомиката и метаболомиката.
Инфографиката по-долу обобщава разликата между протеомиката и метаболомиката.
Обобщение – Протеомика срещу метаболомика
Живите организми могат да бъдат изследвани с помощта на техния геном, протеини и метаболити. Геномиката, протеомиката и метаболомиката са трите области, които изучават съответно генетичния състав, протеините и метаболитите на клетка или организъм. Протеомиката е важна, тъй като е динамично отражение както на гените, така и на околната среда. Метаболомиката е много важна, тъй като пряко отразява текущото състояние на биохимичната реакция на клетките или метаболитния статус на даден организъм. По този начин това обобщава разликата между протеомиката и метаболомиката.
