Разлика между запазена и консенсусна последователност

Съдържание:

Разлика между запазена и консенсусна последователност
Разлика между запазена и консенсусна последователност

Видео: Разлика между запазена и консенсусна последователност

Видео: Разлика между запазена и консенсусна последователност
Видео: Саванте Паабо: подсказки ДНК о нашем внутреннем неандертальце 2024, Юни
Anonim

Ключовата разлика между консервативната и консенсусната последователност е, че консервативната последователност се отнася до подобни последователности от нуклеинови киселини или аминокиселини, които се срещат в различни или едни и същи видове през поколенията, докато консенсусната последователност е често срещана нуклеотидна последователност или открита аминокиселинна последователност в силно консервативна област на ДНК, РНК или протеин.

Организмите споделят сходни, както и различни характеристики. Когато изучаваме връзките между организмите и ги класифицираме, геномът или генетичният състав на организмите е много важен. Има някои нуклеотидни или аминокиселинни последователности, които са общи за различните организми. Консервирана последователност е последователност на нуклеинова киселина или аминокиселина, която е последователна между видовете. Следователно те са филогенетично важни при генерирането на филогенетични дървета. В запазените последователности има специфични нуклеотидни последователности, които се срещат по-често. Те са известни като консенсусни последователности.

Какво е запазена последователност?

Запазената последователност е последователност на нуклеинова киселина или аминокиселинна последователност, която е сходна при различните видове. Следователно, тя е последователна във видовете през цялата еволюция. Обикновено тези последователности се поддържат от естествен подбор. Те остават непроменени далеч назад във филогенетичното дърво. Следователно запазените последователности са важни при конструирането на филогенетични дървета. Смята се, че силно запазените последователности често имат важна функционална стойност. Те са полезни и при идентифициране на генетични заболявания. Въпреки това, запазените последователности могат да бъдат кодиращи или некодиращи последователности на нуклеинова киселина. В допълнение, запазените последователности показват по-бавни скорости на мутация. Следователно те показват много минимални промени в състава си; понякога те не показват промени през всички поколения.

Разлика между запазена и консенсусна последователност
Разлика между запазена и консенсусна последователност

Фигура 01: Запазена последователност

РНК компонентите на рибозомите присъстват във всички области на живота, последователностите на хомеобокса в еукариотите и tmRNA в бактериите са няколко примера за силно запазени последователности. Идентифицирането на запазени последователности е лесно, когато се използват биоинформационни подходи, особено инструментът за подравняване на последователности. Освен това подравняването на множество последователности улеснява визуализацията на запазени последователности.

Какво е консенсусна последователност?

Консенсусната последователност е последователност, която обикновено се среща в даден запазен регион на ДНК или РНК. Това е много специфична нуклеотидна последователност. Като пример, има консенсусна последователност при -10 като TATAAT (кутия Pribnow) в Е. coli промотори, които са силно консервативни последователности. По подобен начин има друга консенсусна последователност: TTGACA в промотори на Е. coli също при -35. Консенсусните последователности са известни също като „кутии“.

Ключова разлика - запазена срещу консенсусна последователност
Ключова разлика - запазена срещу консенсусна последователност

Фигура 02: Консенсусна последователност

В допълнение към ДНК и РНК, протеините също имат консенсусни последователности от аминокиселини. Местата за свързване на протеини често са представени от консенсусни последователности. Рестрикционните ензими също имат консенсусни последователности. Освен това, местата на снаждане също са консенсусни последователности. Подобно на запазените последователности, консенсусните последователности могат да бъдат изчислени и визуализирани чрез инструменти за биоинформатика.

Какви са приликите между запазената и консенсусната последователност?

  • Запазените и консенсусни последователности са последователности от нуклеинова киселина или аминокиселини, които са общи за видовете.
  • Както запазените, така и консенсусните последователности могат да бъдат визуализирани чрез инструменти за биоинформатика.
  • Те се използват широко в молекулярната биология.

Каква е разликата между запазената и консенсусната последователност?

Запазената последователност е последователност на нуклеинова киселина или аминокиселина, която е последователна между видовете, докато консенсусните последователности са много специфични и често срещани бази или аминокиселини в дадена запазена област. И така, това е ключовата разлика между запазената и консенсусната последователност. Нещо повече, друга разлика между консервативната и консенсусната последователност е, че запазените последователности са филогенетично важни, докато консенсусните последователности често са места за свързване на протеини, места на снаждане, места за рязане на рестрикционни ензими и др.

Разлика между запазена и консенсусна последователност в таблична форма
Разлика между запазена и консенсусна последователност в таблична форма

Обобщение – Запазена срещу консенсусна последователност

Запазените последователности са последователностите от нуклеинови киселини или протеини, които са подобни сред живите видове. Промотор, място за свързване на рибозома, начало на репликация и аминокиселинна последователност на хистонов протеин са няколко примера за запазени последователности. Обратно, консенсусните последователности са специфични бази или аминокиселини, които се срещат по-често в дадена запазена последователност. -10 кутия, -35 кутия от E. coli промотор, места за свързване на протеини, места на снаждане и места за разпознаване на рестрикционни ензими са няколко примера за консенсусни последователности. По този начин, това е обобщението на разликата между консервативната и консенсусната последователност.

Препоръчано: