Ключовата разлика между LAMP и PCR теста е, че LAMP се провежда при постоянна температура (60-650C) за получаване на копия на ДНК чрез амплификация, докато PCR се провежда използвайки поредица от температурни промени за получаване на копия на ДНК чрез амплификация.
LAMP и PCR са техники за ин витро амплификация, използвани за получаване на хиляди копия на ДНК. Количеството ДНК, произведено в LAMP, е много по-високо от количеството, произведено в PCR техники като RT-PCR. LAMP е по-нова техника в сравнение с PCR техниката. Но е технически проста и лесна за изпълнение от обучен учен в лабораторни условия. Това го прави потенциално полезна техника за откриване на COVID-19. RT-PCR обаче е настоящият стандартен тест за COVID-19. Тези техники, макар и добре известни на изследователите и клиницистите с опит в ДНК амплификацията, все още може да са относително непознати за по-широката общност.
Какво е LAMP Test?
Изотермична амплификация, медиирана от цикъл (LAMP) за анализи на COVID-19, започва с събиране на проби от носа или гърлото с помощта на тампон. Пробите могат да бъдат взети и с помощта на други методи, като слуз от твърда кашлица. Подобно на PCR техника като RT-PCR, вирусната РНК в пробата първо се преобразува в ДНК, което позволява нейното копиране. LAMP реакцията се провежда при постоянна температура (60-650C).
Амплификацията на вирусна ДНК, включваща LAMP технология и реагенти, може да бъде открита, когато реакционната смес стане мътна поради производството на „магнезиев пирофосфат“. Тази облачност позволява лесно диагностициране на COVID-19 от учени и клиницисти. Точността на резултатите от теста може да се подобри чрез използване на специални флуоресцентни багрила или променящи цвета багрила в реакционната смес. Тези багрила взаимодействат с вирусната ДНК и интензитетът на светлината или промяната на цвета могат да бъдат измерени, за да се даде броят на вирусните РНК молекули, приблизително този, който първоначално е бил в пробата.
Какво е PCR тест?
PCR е много разпространена научна техника, която се използва широко в изследванията и медицината от 20-30 години за откриване на ДНК. PCR тестовете се използват директно за откриване на антиген чрез откриване на вирусна РНК. Обикновено вирусната РНК присъства в тялото преди откриването на антитела или получаването на симптомите на заболяването. Следователно PCR тестът може да разбере дали някой има вируса или не на ранен етап. В момента PCR е стандартният тест за откриване на COVID-19. Има различни видове PCR техники като PCR в реално време, вложена PCR, мултиплексна PCR, PCR с горещ старт и PCR на далечни разстояния и др. PCR използва серия от температурни промени, за да произведе копия на ДНК чрез амплификация.
RT-PCR е специална версия на PCR техниката. Използва се, когато се открива РНК. Сега се използва за тестване на COVID-19. RT-PCR е доста чувствителна и надеждна техника. При RT-PCR, след като се вземе проба, се използват химикали за отстраняване на нежелани протеини, мазнини и други молекули, оставяйки РНК зад себе си. Ензимите на тестовия комплект първо превръщат РНК в ДНК, която след това усилва вирусната ДНК, за да открие вируса. Флуоресцентните багрила обикновено се използват за свързване с амплифицираната ДНК и произвеждане на светлина. Това може да бъде прочетено от машината, за да се получи резултатът от теста.
Какви са приликите между LAMP и PCR теста?
- Те са техники за усилване.
- И двете произвеждат копирана ДНК.
- Те са много чувствителни и надеждни техники от имунната техника като откриването на антитела.
- И двете се използват за тестове за COVID-19.
Каква е разликата между LAMP и PCR тест?
Ключовата разлика между LAMP и PCR тестовете е, че при LAMP амплификацията се постига при използване на постоянна температура (60-650C), докато при PCR цикълът на изискват се температури. В момента са налични няколко типа LAMP техники. Но най-важните за откриване на COVID-19 са изотермичната техника, медиирана от обратна транскрипция, (RT-LAMP) и медиираната от транскрипция амплификация (TMA). Освен това, различни видове PCR техники също са налични в момента в клиничната практика за диагностициране на заболявания, като PCR в реално време, RT-PCR, вложена PCR, мултиплексна PCR, горещ старт PCR, PCR на дълги разстояния и др.
Инфографиката по-долу изброява разликите между LAMP и PCR теста в таблична форма.
Резюме – LAMP срещу PCR тест
Изотермичната амплификация, медиирана от цикъл, е процес, подобен на PCR тестове като RT-PCR, но произвежда повече вирусни ДНК копия при постоянна температура. Тестът за полимеразна верижна реакция в момента е най-разпространената и стандартна форма на тестване в света за диагностициране на заболявания, като диагнозата COVID-19. Смята се за доста надежден. PCR използва серия от температурни промени, за да произведе копия на ДНК чрез амплификация. Така това обобщава разликата между LAMP и PCR теста.
