Ключовата разлика между изошизомерите и неошизомерите е, че изошизомерите са рестрикционни ензими, които имат една и съща последователност на разпознаване и разцепват ДНК на едни и същи позиции, докато неошизомерите са рестрикционни ензими, които имат една и съща последователност на разпознаване, но разцепват ДНК на различни позиции.
Рестрикционните ензими или рестрикционните ендонуклеази са ензими, които разцепват ДНК на фрагменти на или близо до специфични места за разпознаване. Те режат ДНК на рестрикционните места. Рестрикционните ензими обикновено се класифицират в пет групи въз основа на структурата, дали те разрязват своя ДНК субстрат на тяхното място за разпознаване и дали местата за разпознаване и разцепване са отделни едно от друго. Вече са идентифицирани повече от 3600 рестрикционни ендонуклеази. Приблизително 800 рестрикционни ензима се предлагат в търговската мрежа. Изошизомерите и неошизомерите са два вида рестрикционни ензими, базирани на мястото на разпознаване и специфичността на разцепването.
Какво представляват изошизомерите?
Изошизомерите са рестрикционни ензими, които имат една и съща последователност на разпознаване и разцепват ДНК на едни и същи позиции. Тези рестрикционни ензими имат същата специфичност. Първият открит рестрикционен ензим, който разпознава дадена последователност, е известен като прототип, докато всички впоследствие идентифицирани рестрикционни ензими, които разпознават същата последователност, се наричат изошизомери. Въпреки това, изошизомерите могат да се различават по предпочитания за място, реакционни условия, чувствителност към метилиране и звездна активност. Изошизомерите се изолират от различни щамове бактерии. Следователно те могат да изискват различни условия на реакция. В някои случаи само един от двойка изошизомери може да разпознае както метилирани, така и неметилирани форми на рестрикционни места. От друга страна, другият рестрикционен ензим може да разпознае само неметилираната форма на рестрикционния сайт. Тази специфична характеристика на изошизомерите помага за идентифициране на състоянието на метилиране на мястото на рестрикция, като същевременно го изолира от бактериално състояние.
Например, AgeI и BshT1 разпознават и разцепват 5’-A↓CCGGT по същия модел. HpaII и MSPI са други двойки изошизомери. И двамата разпознават последователността 5’-C↓CGG-3’, когато е неметилирана. Но когато вторият С от последователността е метилиран, само MSPI може да разпознае тази последователност, докато HpaII не може да я разпознае.
Какво са неошизомерите?
Неошизомерите са рестрикционни ензими, които имат една и съща последователност на разпознаване, но разцепват ДНК на различни позиции. В някои специални молекулярно-биологични приложения това е много полезна функция. Неошизомерите са подгрупа на изошизомерите. Добре известни примери за неошизомери са SmaI (5’-CCC↓GGG-3’) и XmaI (5’-C↓CCGGG-3’); и двете разпознават последователността 5’-CCCGGG-3’, но ги разцепват на различна позиция. По този начин тези два рестрикционни ензима генерират различни видове краища. В този случай SmaI произвежда тъпи краища, а XmaI произвежда 5' стърчащи краища.
Фигура 01: Неошизомери
Друг пример е двойката рестрикционни ензими MaeII и Tail. Прототип MaeII (A↓CGT) произвежда ДНК фрагменти с 2-базово разширение 5', а неошизомерната опашка (ACGT↓) произвежда ДНК фрагменти с 4-базово 3' разширение.
Какви са приликите между изошизомерите и неошизомерите?
- Изошизомерите и неошизомерите са два вида рестрикционни ензими.
- Срещат се предимно в прокариотите.
- Те са част от системата за рестрикционна модификация (RM), открита в бактериите и археите.
- И двете са протеинови молекули.
- И двете разцепват ДНК на фрагменти.
Каква е разликата между изошизомерите и неошизомерите?
Изошизомерите са рестрикционни ензими, които имат една и съща последователност на разпознаване и разцепват ДНК на едни и същи позиции, докато неошизомерите са рестрикционни ензими, които имат една и съща последователност на разпознаване, но разцепват ДНК на различни позиции. И така, това е ключовата разлика между изошизомерите и неошизомерите. Освен това изошизомерите имат еднакви специфики, докато неошизомерите имат различни специфики.
Следващата инфографика изброява разликите между изошизомерите и неошизомерите в таблична форма за сравнение едно до друго.
Резюме – Изошизомери срещу Неошизомери
Рестрикционните ензими са ензими, разрязващи ДНК. Те се наричат още молекулярни ножици. Има различни видове рестрикционни ензими. Въз основа на мястото на разпознаване и специфичността на разцепването, рестрикционните ензими са два вида като изошизомери и неошизомери. Изошизомерите имат една и съща последователност на разпознаване и разцепват ДНК на едни и същи позиции, докато неошизомерите имат същата последователност на разпознаване, но разцепват ДНК на различни позиции. По този начин, това е ключовата разлика между изошизомерите и неошизомерите.
