Ключовата разлика между изошизомерите и изокаудомерите е, че изошизомерите разпознават и разцепват едно и също място на рестрикция или разпознаване, докато изокаудомерите разпознават малко по-различни места на рестрикция и се разцепват на едно и също място.
Рестрикционните ензими или рестрикционните ендонуклеази са вид нуклеази, които разцепват двойноверижна ДНК. Те са в състояние да разпознаят специфични последователности, наречени рестрикционни сайтове, които са палиндромни по произход. Бактериите произвеждат рестрикционни ензими срещу чужди патогени, особено срещу вируси. Това е форма на защитен механизъм, проявен от бактериите. В зависимост от структурата на ензима и естеството на срязванията има три вида рестрикционни ензими като рестрикционни ензими тип I, рестрикционни ензими тип II и рестрикционни ензими тип II. Освен това, в зависимост от биохимичната активност и източника на изолиране, има три вида рестрикционни ензими като изошизомери, неошизомери и изокаудомери.
Какво представляват изошизомерите?
Изошизомерите са вид рестрикционни ензими, които идват от различни източници, но разпознават и разцепват едно и също рестрикционно място в ДНК. Следователно два изошизомера имат едно и също място за разпознаване. Те се разцепват на едно и също място, така че са специфични за една и съща последователност на разпознаване. Например, рестрикционните ензими SphI и BbuI са два изошизомера, които разпознават и разцепват при CGTAC/G.
Фигура 01: Рестрикционен ензим
Друга двойка изошизомери е HpaII и MspI. И двамата разпознават последователността 5'-CCGG-3' и разцепват ДНК. Нещо повече, Bsp EI и Acc III също са изошизомери, които са съответно от вид Bacillus и Acinetobacter calcoaceticus. Изолирането на изошизомерите може да се извърши от различни бактерии. Тъй като те идват от различни бактерии, условията за тяхното ограничаване може да са различни едно от друго.
Какво са изокаудомери?
Изокаудомерите са вид рестрикционни ензими, които разпознават малко по-различни последователности, но те се разцепват на едно и също място, за да произведат същите краища. Изокаудомерите също идват от различни бактерии. Sau3a и BamHI са двойка изокаудомери. Те произвеждат 5’-GATC-3’ лепкав край след разцепване на същото място. Друга двойка изокаудомери е NcoI от Nocardia corallina и PagI от Pseudomonas alcaligenes. Тези два ензима също се свързват в различни последователности на разпознаване, но режат на едно и също място и произвеждат същите лепкави краища. Следователно, произвежданите режещи краища са съвместими един с друг и могат да бъдат лигирани един към друг. XhoI, PspXI и SalI също са изокаудомери.
Какви са приликите между изошизомерите и изокаудомерите?
- Изошизомерите и изокаудомерите са два вида рестрикционни ензими.
- Два изошизомера имат едно и също място на смилане, подобно на два изокаудомера, които имат едно и също място на смилане.
- Те са прокариотни по произход.
- И двете имат място за разпознаване на ограниченията, както и място за смилане.
- Произвеждат краища, които са съвместими един с друг.
- В допълнение, тези ензими са полезни инструменти в рекомбинантната ДНК технология.
Каква е разликата между изошизомерите и изокаудомерите?
Изошизомерите са рестрикционни ензими, които разпознават една и съща ДНК последователност и се разцепват на едно и също рестрикционно място, докато изокаудомерите са рестрикционни ензими, които разпознават малко по-различни ДНК последователности, но произвеждат същите лепкави краища чрез срязване на едно и също място. И така, това е ключовата разлика между изошизомерите и изокаудомерите.
Инфографиката по-долу представя в таблица разликата между изошизомерите и изокаудомерите.
Обобщение – Изошизомери срещу изокаудомери
Изошизомерите са рестрикционни ензими, които разпознават една и съща ДНК последователност и се разцепват на едно и също място. От друга страна, изокаудомерите са рестрикционни ензими, които разпознават малко по-различни последователности и се разцепват на едно и също място, произвеждайки същите краища. По този начин, това е ключовата разлика между изошизомерите и изокаудомерите. SphI, BbuI, HpaII и MspI са няколко примера за изошизомери, докато Sau3a и BamHI са два примера за изокаудомери. Както изошизомерите, така и изокаудомерите се произвеждат естествено от бактерии.
