Ключовата разлика между EcoRI и HindIII рестрикционните ензими е, че EcoRI е тип II рестрикционен ензим, който е изолиран от Е. coli, докато HindIII е тип II рестрикционен ензим, който е изолиран от Haemophilus influenza.
Рестрикционният ензим или рестрикционната ендонуклеаза е ензим, който разцепва ДНК на фрагменти в специфични места за разпознаване (рестриктазни места) в рамките на ДНК молекулата. Тези рестрикционни ензими се намират в бактерии и археи. Те осигуряват защитен механизъм срещу нахлуващи вируси. Рестрикционните ензими обикновено се класифицират в пет различни типа: тип I, тип II, тип III, IV и тип V. EcoRI и HindIII са два рестрикционни ензима, които принадлежат към групата на рестрикционните ензими тип II.
Какво представляват рестрикционните ензими EcoRI?
EcoRI е тип II рестрикционен ензим, който е изолиран от видове E.coli. Това е рестрикционен ензим, който разцепва двойните спирали на ДНК на фрагменти на определени места. EcoRI също е част от системата за ограничаване и модифициране. EcoRI е първият ензим, който първоначално е изолиран от щама RY13 на вида Е. coli. Използва се като рестрикционен ензим в молекулярната биология. EcoRI създава 4 нуклеотидни лепкави краища с 5' крайни надвеси на AATT. EcoRI разрязва ДНК в специфичната последователност за разпознаване G↓AATTC. Той има палиндромна комплементарна последователност на CTTAA↓G. Освен това, този рестрикционен ензим принадлежи към подклас тип II P (палиндромна специфичност). В своята първична структура EcoRI съдържа PD. D/EXK мотива в своето активно място, подобно на много други рестрикционни ензими.
Фигура 01: EcoRI
EcoRI рестрикционният ензим е хомодимер от 31 kDa. Той съдържа един глобуларен домейн на α/β архитектурата. Всяка субединица съдържа примка, която стърчи от глобуларния домен и се увива около ДНК, когато е свързана. Този ензим може да бъде кокристализиран с последователността, която обикновено прекъсва. Освен това, рестрикционният ензим EcoRI се използва в голямо разнообразие от молекулярно-генетични техники, включително клониране, ДНК скрининг и делеционни секции на ДНК in vitro условия.
Какво представляват рестрикционните ензими HindIII?
HindIII е тип II рестрикционен ензим, който е изолиран от Haemophilus influenza видове. Той разцепва ДНК палиндромната последователност AACCTT в присъствието на кофактора Mg2+ чрез хидролиза. Разцепването на тази конкретна последователност между AA’S (5’A↓ACCTT3’ и 3’TTCGA↓A5’) води до 5’ надвеси върху ДНК молекулата, наречени лепкави краища. Този ензим се намира в прокариотни организми като бактерии. Бактериите използват този ензим като защитен механизъм срещу вируси като бактериофаги.
Фигура 02: HindIII
Структурно, HindIII е хомодимер. Той съдържа общо структурно ядро, включващо четири β листа и единични α спирали, подобно на други видове II рестрикционни ензими. Молекулната маса на този ензим е 34,9 kDa. Освен това HindIII е много полезен в съвременните молекулярно-биологични научни експерименти, като секвениране и картографиране на ДНК.
Какви са приликите между EcoRI и HindIII рестрикционните ензими?
- EcoRI и HindIII са два рестрикционни ензима, принадлежащи към групата на рестрикционните ензими тип II.
- EcoRI и HindIII са открити в началото на 70-те години.
- EcoRI и HindIII съдържат мотива на аминокиселинната последователност PD.. D/EXK.
- И двата рестрикционни ензима извършват много специфично разцепване на ДНК.
- Тези рестрикционни ензими се нуждаят от Mg2+ като кофактор за тяхната специфична активност.
- Произвеждат лепкави краища след разрязване на ДНК.
- Те са много полезни компоненти в съвременните молекулярно-биологични изследвания.
Каква е разликата между EcoRI и HindIII рестрикционните ензими?
EcoRI е рестрикционен ензим тип II, който е изолиран от видове E.coli, докато HindIII е рестрикционен ензим тип II, който е изолиран от видове Haemophilus influenza. По този начин това е ключовата разлика между EcoRI и HindIII. Освен това, EcoRI разрязва ДНК при специфичната последователност за разпознаване G↓AATTC, докато HindIII отрязва ДНК при специфичната последователност за разпознаване A↓ACCTT.
Инфографиката по-долу представя разликите между EcoRI и HindIII в таблична форма за сравнение едно до друго.
Резюме – EcoRI срещу HindIII рестрикционни ензими
EcoRI и HindIII са два рестрикционни ензима, които принадлежат към подклас тип II p. Те извършват много специфично разцепване на ДНК. EcoRI е тип II рестрикционен ензим, който е изолиран от E.coli видове, докато HindIII е тип II рестрикционен ензим, който е изолиран от Haemophilus influenza видове. И така, това обобщава разликата между EcoRI и HindIII.
