Транспозон срещу ретротранспозон
Транспозоните и ретротранспозоните са генетични компоненти на ДНК и има големи разлики между тях. Процентното присъствие на тези генетични материали варира при различните видове и техните функции определят съдбата на организма с мутации и други фенотипно важни промени. Транспозоните и ретротранспозоните са гени или колекции от определени гени, разположени във веригите на ДНК, и промените в тяхното местоположение са основните причини за тези последствия. Тази статия обаче има за цел да обсъди накратко функциите на тези гени и представя сравнение между транспозони и ретротранспозони.
Какво е Transposon?
Транспозоните са интересни фрагменти или сегменти от ДНК със способността да променят местоположението на ДНК веригата под формата на механизъм за изрязване и поставяне. Поради този мобилен характер на транспозоните, те са известни като скачащи гени. Транспозоните са от два основни типа, известни като транспозони от клас I и транспозони от клас II. Обикновено типът от клас II се нарича транспозони, а типът от клас I се нарича ретротранспозони. Процесите на рязане и поставяне на мобилни ДНК сегменти се регулират от ензима транспозаза. Ензимът се свързва с двата края на транспозона и прекъсва фосфодиестерните връзки на ДНК веригата, изолира транспозона, премества го в целевото място и се свързва на новото място. Въпреки това, този процес е интересен за разбиране, тъй като някои транспозони могат да се движат само до определени места само поради несъвместимостта на базовите последователности с целевото място. Гените с единия край на една единствена верига имат същата базова последователност с другия край на другата единична верига са транспозони с лепкави ръбове, тъй като те могат да се свързват към местата на целевата ДНК верига със същата базова последователност като в лепкавите краища. Въпреки това, тази мобилност на гените може да причини промени в генотипа, както и във фенотипа на организма. След това бяха предоставени учени, изобретени за транспозоните и генетично модифицирани храни и организми според предпочитаните персонализации. Високопродуктивни селскостопански култури, антибиотици с лечебни свойства, добитък са някои от изгодно разработените продукти след изобретяването на транспозоните от Барбара МакКлинток през 1940 г.
Какво е ретротранспозон?
Ретротранспозоните са транспозони от клас I и те се движат през генома чрез механизма на копиране и поставяне. Механизмът на мобилността на ретротранспозоните включва няколко основни стъпки като копиране на генния сегмент на ДНК веригата в РНК, прехвърляне на копието на РНК към целевото място, транскрипция на РНК последователността обратно в ДНК с помощта на обратна транскриптаза и вмъкване на гена в новото местоположение на ДНК веригата на генома. Двата края на тези ретротранспозони обикновено имат дълги крайни повторения с около 1000 базови двойки и те се използват като идентификационни характеристики на тези гени. Тези гени лесно се амплифицират вътре в генома и процентът на ретротранспозоните в човешкия геном е около 50%. Те могат да бъдат доста опасни, тъй като вирусът причинител на СПИН, ХИВ и вирусът на Т-клетъчна левкемия имат ретротранспозони в своите РНК геноми. Всъщност тези вируси могат да свържат ретротранспозоните във всяко място на човешката ДНК нишка с помощта на обратна транскриптаза и интеграза. Ензимът интеграза функционира по същия начин като транспозазата в транспозони от клас II.
Каква е разликата между транспозон и ретротранспозон?
• Транспозоните са скачащи гени от клас II, докато ретротранспозоните попадат в категорията на клас I.
• Транспозоните функционират с ензима транспозаза, докато ретротранспозоните функционират с помощта на два основни ензима, известни като обратна транскриптаза и интеграза.
• Терминалните краища са много по-дълги в ретротранспозоните, отколкото в транспозоните.
• Транспозоните се изрязват от началото и се поставят в целта; обратно, ретротранспозоните се копират от произхода в РНК и се транскрибират в целта.
• Преместването на ретротранспозони включва РНК, но не и в транспозони.
