Ключова разлика – Exome срещу Transcriptome
Генът съдържа кодиращи и некодиращи области в него. Кодиращите последователности са известни като екзони, а некодиращите последователности са известни като интрони. Нуклеотидната последователност на екзоните на гена представлява генетичния код на гена за синтезиране на специфичния протеин. Следователно екзоните остават в молекулата на иРНК. Цялата екзонова област на генома е известна като екзома и е важна част от генома. Генетичният код на гените се преобразува в генетичния код на иРНК молекулата, която е необходима за производството на протеин. Целите иРНК молекули, транскрибирани в клетка или клетъчна популация наведнъж, са известни като транскриптом. Ключовата разлика между екзома и транскриптома е, че екзомът представлява последователностите на екзоновите региони на генома, докато транскриптомът представлява общата иРНК на клетка или тъкан в даден момент.
Какво е Exome?
Гените са съставени от екзони, интрони и регулаторни последователности. Екзоните са генните региони, които се транскрибират в иРНК последователност по време на транскрипцията. Интрони и други некодиращи области се отстраняват по време на транскрипцията. Нуклеотидната последователност на екзоните определя генетичния код на гена, който синтезира специфичния протеин, който кодира. Само екзони остават в иРНК на протеин. Колекцията от екзони в генома е известна като екзом на организъм. Представлява част от генома, която се изразява в гени. При хората екзомът представлява 1% от генома. Това е кодиращата протеин част от човешкия геном.
Фигура 01: Exome
Какво е Transcriptome?
Транскриптомът е съвкупността от всички протеинови кодиращи и некодиращи транскрипти (РНК) в дадена тъкан. Транскриптомът представлява съвкупността от общи молекули иРНК, експресирани от гените в клетка или тъкан. Транскриптомът на една клетка може да се променя с транскриптома на друг тип клетка. Транскриптомът също е динамичен – той се променя с времето в отговор на вътрешни и външни стимули. Дори в една и съща тъкан или в рамките на същия клетъчен тип, транскриптомът може да се промени след няколко минути.
Транскриптомът се различава от екзома на даден организъм. Транскриптомът включва само експресираните екзомни последователности. Въпреки че екзомът на клетката остава същият, транскриптомът се различава между клетките, тъй като генната експресия не е еднаква за всички клетки или тъкани. Само основните гени се експресират в различни клетки и тъкани. Генната експресия е специфичен за тип тъкан или клетка процес. Регулира се от различни фактори, включително фактори на околната среда. Следователно транскриптомът може да варира в зависимост от външните условия на околната среда.
Транскриптомът се използва като прекурсор за протеомни изследвания. Всички протеини са получени от иРНК последователности. Транслационните модификации могат да доведат до промени в протеините. Транскриптомът обаче предоставя важна основна информация за протеомните изследвания.
Фигура 02: Транскриптом на ембрионални стволови клетки
Каква е разликата между Exome и Transcriptome?
Exome срещу Transcriptome |
|
| Exome е колекцията от протеиново кодиращи региони на гените. | Транскриптомът е колекцията от всички транскрибирани РНК, включително иРНК. |
| Проба | |
| Exome се изследва с помощта на ДНК проба. | Транскриптомът се изследва с помощта на РНК проба. |
| Метод на изследване | |
| Секвенирането на целия екзом е методът за изучаване на екзом. | Секвенирането на РНК е методът за изследване на транскриптома. |
Резюме – Exome срещу Transcriptome
Екзоните са кодиращите последователности на гените и определят иРНК последователностите на протеините. Съвкупността от тези кодиращи последователности (екзони) е известна като екзом на организъм. Гените се транскрибират в иРНК молекули преди производството на протеини. Общите иРНК молекули на клетка или тъкан във всеки даден момент са известни като транскриптом. Транскриптомът представлява гените, които се експресират активно в иРНК във всеки даден момент. Транскриптомът е специфичен за клетките и тъканите и влияе върху условията на околната среда. Това е разликата между екзом и транскриптом.
