Ключовата разлика между FISH и CGH е, че FISH е молекулярна техника, която открива специфична ДНК последователност на хромозома с помощта на флуоресцентно белязани сонди, докато CGH е друга молекулярна цитогенетична техника, която открива промени в геномната ДНК.йени
Цитогенетичният анализ играе важна роля в медицината при откриване на хромозомни аномалии като анеуплоидии, делеции, дупликации и пренареждания и др. Хромозомните аномалии в крайна сметка водят до генетични заболявания като рак, безплодие, синдром на Даун, синдром на Клайнфелтер, Търнър синдром, левкемия и др. Съществуват различни молекулярни цитогенетични методи за откриване на гореспоменатите дефекти и заболявания. Сред тях FISH (флуоресцентна in situ хибридизация) и CGH (сравнителна геномна хибридизация) са две мощни техники за хибридизация. И двата метода обаче имат плюсове и минуси.
Какво е РИБА?
FISH е техника за хибридизиране на нуклеинови киселини, извършвана върху част или секция от тъкан, в цялата тъкан или клетки. Това е метод, базиран на сонда. Техниката зависи от теорията за сдвояване на комплементарни бази на Watson Crick, което води до ДНК-ДНК хибриди или ДНК-РНК хибриди, които по този начин могат да открият мутирали гени или да идентифицират гена, който представлява интерес. Освен това, тази техника използва едноверижни ДНК последователности, двойноверижни ДНК последователности, едноверижни РНК последователности или синтетичен олигонуклеотид, приготвен чрез използване на ник транслация като сонди, които са комплементарни на генните последователности от интерес. Освен това, най-важната характеристика на тази техника е маркирането на сондите с флуоресцентни багрила. По този начин сондите се свързват с комплементарните части на хромозомата и я правят лесна за откриване.
Освен това FISH е много чувствителен и специфичен метод. Следователно, това е често срещана техника както при изследване, така и при диагностициране на хематологични злокачествени заболявания и солидни тумори. Но FISH показва ниска резолюция. Също така се изисква предварително познаване на целевата аномалия, за да се проектират последователности от сонда.
Фигура 01: РИБА
Има много приложения на FISH, главно в молекулярната диагностика на инфекциозни заболявания за идентифициране на наличието на патогени и за потвърждаване на патогена чрез молекулярна диагностика. Освен това FISH е често използвана техника в областта на биологията на развитието, кариотипирането и филогенетичния анализ и физическото картографиране на хромозомите.
Какво е CGH?
Сравнителната геномна хибридизация (CGH) е друга ДНК базирана молекулярна цитогенетична техника, която може да открие промените в геномните ДНК последователности. Методът е усъвършенстван метод, който може да анализира хромозомни и генни модификации, за да открие промените или промените в геномните ДНК последователности. Освен това CGH изисква изолиране и фрагментиране на ДНК от експерименталната проба и референтната проба. След това пробите трябва да бъдат етикетирани с две различни флуоресцентни багрила (обикновено червено и зелено). По-късно двете проби се смесват и се оставят за конкурентна хибридизация. Последната стъпка е анализът на пробите за промени в ДНК, като генно дублиране, загуба на ген и т.н. По-специално, той измерва разликите в броя на ДНК копията между тестовата и контролната проба.
Фигура 02: CGH
Сега е налична друга версия на CGH; това е по-напреднал метод от нормалния CGH. Това е техника, наречена базирана на масив CGH или aCGH. aCGH позволява прецизното идентифициране на делеции на ген или последователност в много хиляди последователности в един единствен експеримент.
Какви са приликите между FISH и CGH?
- FISH и CGH са две молекулярни техники.
- Както FISH, така и CGH разчитат на хибридизация на нуклеинова киселина.
- Освен това и двете техники се нуждаят от проектирани сонди за откриване на специфични ДНК цели.
- Използваме ги за пренатална и постнатална диагностика на генетични заболявания.
- Освен това, както FISH, така и CGH са много мощни инструменти за изследване на геномни промени.
- Използват флуоресцентни багрила за етикетиране на сонди.
Каква е разликата между FISH и CGH?
FISH е процедура за хибридизация in situ, която използва флуоресцентни сонди за откриване на специфични ДНК последователности, докато CGH е техника за молекулярна хибридизация, която открива промените на геномни ДНК последователности. И така, това е ключовата разлика между FISH и CGH.
Освен това, FISH изисква предварителни познания за целевата аномалия, за да проектира последователности на сонда, докато CGH не изисква предварителни познания. Също така, допълнителна разлика между FISH и CGH е, че FISH показва ограничена разделителна способност, докато aCGH показва висока разделителна способност.
Инфографиката по-долу обобщава разликата между FISH и CGH.
Обобщение – FISH срещу CGH
FISH и CGH са две молекулярни цитогенетични техники, които улесняват откриването на интересни генни последователности. FISH улеснява откриването на специфична ДНК последователност на хромозома с помощта на флуоресцентно маркирани сонди, докато CGH улеснява откриването на промени в геномната ДНК. И така, това е ключовата разлика между FISH и CGH.
