Ключовата разлика между QTL и GWAS разчита на типа последователности, използвани в анализа. QTL използва генни локуси на свързване, за да анализира фенотипни черти, свързани с полигенно наследяване, докато GWAS използва цели геномни последователности, за да анализира единични нуклеотидни полиморфизми на конкретно състояние.
QTL картите и GWAS играят важна роля в генетичните анализи за различни черти. Освен това те са важни при анализирането на различни болестни състояния с неизвестна етиология. В допълнение, последователността играе ключова роля и в двете техники. Тези техники могат допълнително да бъдат съчетани с други техники с висока производителност за повишена точност и прецизност.
Какво е QTL?
QTL означава Quantitative Trait Locus. Това е област от ДНК, свързана с фенотипна черта. Като цяло, QTL води до полигенни ефекти. Разпределението на QTL варира и броят на QTL предполага степента на вариация на определена фенотипна черта. Освен това, те обикновено кодират основните непрекъснати черти, а не дискретни черти.
При идентифицирането на QTL регионите е важно да се секвенира конкретна QTL област. Освен това, за да се направят разследванията и изследванията лесни, секвенирането и съхраняването на данните за последователностите на общите QTL региони се извършва с участието на биоинформатика. Ние наричаме тази техника QTL картографиране. Впоследствие се изгражда база данни с последователностите на QTL региона.
Фигура 01: QTL сканиране
Освен това, приложенията на QTL последователностите разчитат главно на инструмента BLAST, където може да се определи сходството на последователностите. Важно е при извеждането на връзките между организмите. Освен това, това е важно при определяне на сложността на определен полигенен фенотип. Той също така определя еволюцията на определена черта.
Понастоящем QTL анализът се комбинира с други високопроизводителни техники като ДНК микрочипове. Това е важно при анализа на експресията на фенотипа. В момента учените са много заинтересовани от разработването на QTL база данни, тъй като QTL регионите са отговорни за много важни черти на различни видове.
Какво е GWAS?
GWAS означава Проучване на широката асоциация на генома. Също така се отнася до проучвания за асоцииране на целия геном. Тези проучвания се фокусират главно върху наблюдателни проучвания. Той анализира генетичните варианти на различни индивиди, обикновено свързани с определена черта. Освен това целият геном е важен за GWAS анализа.
Фигура 02: GWAS
GWAS е важен инструмент при анализа на единични нуклеотидни полиморфизми, свързани с различни болестни състояния. Това също е сравнително изследване на различните единични нуклеотидни полиморфизми в широка популация. В допълнение, извадката за изследване на GWAS е много висока; следователно, то също приема формата на междусекторно кохортно проучване.
Освен това, първото проучване на GWAS се проведе по отношение на инфаркт на миокарда и анализиране на гените, свързани с инфаркт на миокарда. Понастоящем GWAS играе важна роля в определянето на генетичния фон на сложни заболявания с неизвестна етиология.
Какви са приликите между QTL и GWAS?
- Те разчитат на данни от ДНК последователности за анализа.
- И двете са свързани с генетичния произход на различни герои.
- Освен това, те изискват биоинформатични инструменти за извеждане и тълкуване на резултатите.
- Извършват се върху големи популации.
Каква е разликата между QTL и GWAS?
QTL анализира фенотипните черти, свързани с полигенното наследство, използвайки свързани генни локуси, докато GWAS анализира единични нуклеотидни полиморфизми на конкретно състояние, използвайки последователности от целия геном. По този начин това е ключовата разлика между QTL и GWAS. QTL картографирането е сравнително по-малко сложна техника от GWAS, тъй като изисква секвениране на целия геном.
Инфографиката по-долу обобщава разликата между QTL и GWAS в таблична форма.
Обобщение – QTL срещу GWAS
QTL картографирането и GWAS играят основна роля в определянето на генетичния фон на различни фенотипни черти. Те също така помагат при анализирането на генетичната основа на различни заболявания. Картографирането на QTL картографира гените на свързване, отговорни за непрекъснатите черти, и също така включва картографиране на полигенните гени за наследяване. GWAS, от друга страна, се извършва с анализ на целия геном за единични нуклеотидни полиморфизми. Освен това това се случва в по-голяма популация. Така това е обобщението на разликата между QTL и GWAS.
