Ключовата разлика между праймера и промотора е, че праймерът е комерсиално синтезирана къса ДНК последователност, която се използва в PCR за амплификация на целева ДНК последователност, докато промоторът е специфична ДНК последователност, която осигурява сигурно първоначално място за свързване на РНК полимераза и транскрипционни фактори, за да се инициира транскрипция.
Праймерът и промоторът са два вида ДНК последователности. Праймерът е малък фрагмент от ДНК, необходим за полимеразна верижна реакция (PCR). Той има къси нуклеотидни последователности, комплементарни на страничния край на ДНК веригата. Има два вида праймери и те работят като отправна точка за синтеза на нови ДНК вериги. За разлика от това, промоторът е специфична ДНК последователност, разположена преди мястото на иницииране на транскрипция на ген. Той директно взаимодейства с компонентите на транскрипционния механизъм като РНК полимераза и транскрипционни фактори, за да контролира транскрипцията на ДНК. Следователно РНК полимеразата и други транскрипционни фактори се свързват с промоторната последователност и инициират транскрипцията.
Какво е буквар?
Праймерите са къси ДНК последователности, предназначени за амплификация на целеви ДНК последователности. В структурно отношение те притежават къси нуклеотидни последователности, комплементарни на страничните краища на двойните вериги на ДНК. Те обикновено са дълги около 20 нуклеотида. По време на PCR Taq полимеразата катализира добавянето на нуклеотиди към съществуващата нуклеотидна последователност. Следователно праймерите служат като отправни точки за синтеза на нови нишки. Taq полимеразата работи само в посока 5' към 3'. Следователно синтезът на ДНК също се извършва в същата посока от 5' до 3'. Тъй като ДНК е двуверижна, в PCR са необходими два вида праймери. Те са известни като преден праймер и обратен праймер, въз основа на посоката на удължаване на праймера по време на синтеза на ДНК.
Фигура 01: Грундове
Предният праймер се свързва с антисенс ДНК верига и инициира синтеза на + верига на гена в посока 5' към 3'. Той има къса нуклеотидна последователност, която е комплементарна на 3' страничния край на антисенс веригата. Обратният праймер се свързва със сетивната верига и инициира синтеза на комплементарна верига на кодиращата верига, която е – верига на гена в посока 5’към 3’. По този начин, обратният праймер е проектиран като допълнение към 3' края на кодиращата верига. Както обратните, така и правите праймери са важни за производството на милиони до милиарди копия на определени региони на ДНК, които са насочени или заинтересовани.
Какво е промоутър?
Промоторът е ДНК последователност, разположена нагоре по веригата или в 5' края на мястото на иницииране на транскрипция на ген. Той осигурява място за свързване на РНК полимераза и определени регулаторни елементи, за да започне транскрипцията на гена. Това е регулаторна последователност, необходима за включване или изключване на ген. В промотора има специфична нуклеотидна последователност. Може да има 100–1000 базови двойки. Промоторът показва посоката на транскрипция. Освен това, той показва сетивната нишка, която трябва да бъде транскрибирана.
Фигура 02: Промотор на ген
Има три вида промоторни елементи като основен промотор, проксимален промотор и дистален промотор. Основният промотор е минималната част от промотора, необходима за иницииране на транскрипция. Той е разположен най-близо до началния кодон. TATA кутията е запазена област, открита в много еукариотни основни промотори. Намира се 25 до 35 базови двойки нагоре по веригата от началния сайт на транскрипция. Проксималният промотор се намира по-нагоре по веригата спрямо основния промотор. Обикновено той е разположен 250 базови двойки нагоре по течението на началния кодон и съдържа първични регулаторни елементи. Дисталният промотор се намира нагоре по течението на проксималния промотор и съдържа допълнителни регулаторни елементи. Бактериалните промотори имат два елемента с къса последователност в своите промотори. TATAAT е консенсусната последователност, разположена при -10 на бактериален промотор, докато TTGACA е консенсусната последователност при -35. Те са известни като -10 елемент и -35 елемент.
Какви са приликите между Primer и Promoter?
- Праймерът и промоторът са два вида ДНК последователности.
- Състоят се от нуклеотидни последователности.
- Както праймерът, така и промоторът са важни за генната експресия.
Каква е разликата между Primer и Promoter?
Праймерът е къса нуклеотидна последователност, предназначена за амплификация на целевата ДНК. За разлика от това, промоторът е специфична регулаторна ДНК последователност, намираща се преди мястото на иницииране на транскрипция на ген. И така, това е ключовата разлика между праймера и промотора. Праймерите са дълги около 20 базови двойки, докато промоторът може да има 100 -1000 базови двойки. Функционално праймерите служат като начални последователности за синтеза на нова верига, докато промоторите контролират генната транскрипция чрез осигуряване на места за свързване за РНК полимераза и други транскрипционни фактори.
Освен това, промоторът се определя като посоката на транскрипцията и показва сенс веригата на гена. Структурно праймерът е къса едноверижна ДНК последователност, докато промоторът е дълга двойноверижна ДНК последователност.
Информационната графика по-долу показва повече сравнения, свързани с разликата между праймер и промотор.
Резюме – Primer vs Promoter
Праймерите са къси нуклеотидни последователности, комплементарни на страничните краища на двойната верига на целевата ДНК. При PCR се използват два вида праймери. Те служат като начални последователности за синтеза на нови нишки. Праймерите са комерсиално предназначени и са температурно стабилни последователности. От друга страна, промоторът е регулаторна последователност на ген, разположен преди мястото на започване на транскрипцията. Промоторите контролират транскрипцията на гените. Те осигуряват места за свързване на РНК полимераза и транскрипционни фактори за иницииране на транскрипция. Така това е обобщението на разликата между праймер и промотор.
