Ключовата разлика между фрагмента на Klenow и ДНК полимераза 1 е, че фрагментът на Klenow е голяма част от ДНК полимераза 1, на която липсва 5' до 3' екзонуклеазна активност, докато ДНК полимеразата е ензим на E. coli, който има и трите домейни, включително 5' до 3' екзонуклеазна активност.
ДНК полимеразата е един от ключовите ензими, участващи в репликацията на ДНК в живите организми. Има различни форми на ензим ДНК полимераза, открити в еукариоти и прокариоти въз основа на размера и формата. ДНК полимераза 1, 2 и 3 се срещат само в прокариотни организми и играят различни роли в репликацията на ДНК. ДНК полимераза 1 има три домена с 5' до 3' полимеразна, 3' до 5' екзонуклеазна активност и 5' до 3' екзонуклеазна активност. Фрагментът на Klenow е протеолитичен продукт на ДНК полимераза 1. Той притежава 5 до 3' полимеразна и 3' до 5' екзонуклеазна активност на интактна ДНК полимераза 1, но му липсва 5' до 3' екзонуклеазна активност.
Какво е фрагмент Кленов?
Klenow фрагмент е голяма част от ДНК полимераза 1. За разлика от ДНК полимераза 1, 5' до 3' екзонуклеазна активност не се наблюдава във фрагмента Klenow, тъй като му липсва 5' до 3' преден екзонуклеазен домен. Фрагментите на Klenow се произвеждат чрез смилане на ДНК полимераза 1 с протеаза, наречена субтилизин, която е ензим за смилане на протеини. В някои приложения 3' до 5' екзонуклеазната активност на фрагмента Klenow става нежелана. Той може да бъде премахнат чрез въвеждане на мутация в гена, който кодира фрагмента Klenow. Полученият ензим, който има само 5' до 3' полимеразна активност, е известен като екзо-Klenow фрагмент. Морфологично фрагментът от Кленов прилича на човешката дясна ръка. Той има N-терминален 3'-5' екзонуклеазен домен и С-терминален полимеразен домен, разделени от около 30 A.
Фигура 01: Фрагмент на Klenow и ДНК полимераза 1
Фрагментът на Кленов е важен инструмент в молекулярно-биологичните техники. Фрагментите от Klenow имат множество приложения. Те са изключително важни при клонирането с тъп край, за да се получат тъпи фрагменти. Фрагментите Klenow могат да премахнат 3' надвеси или да запълнят 5' надвеси, за да образуват тъпи краища. Освен това фрагментите на Klenow се използват за синтезиране на двойноверижна ДНК от единични вериги. Освен това, те се използват за приготвяне на радиоактивно маркирани сонди, като се използва 5'до 3' ДНК зависима ДНК полимеразна активност.
Какво е ДНК полимераза 1?
ДНК полимераза 1 (Pol 1) е ензим, открит в прокариотите, който е необходим за репликацията на бактериална ДНК. Това е първият тип ДНК полимераза, открита от Артър Корнберг през 1956 г. Pol 1 е най-разпространената полимераза в Е. coli. Той е кодиран от гена polA и се състои от 928 аминокиселини. Състои се от три домейна. И трите домейна изпълняват различни функции. Два домена осъществяват 5' до 3' екзонуклеазна активност и 3' до 5' екзонуклеазна активност. Поради тази активност, притежавана от Pol 1, той е популярен като ензим за възстановяване на ДНК, а не като ензим за репликация на ДНК. Третият домейн има способността да катализира множество полимеризации (5' до 3') преди освобождаването на шаблонната ДНК и свързването на Okazaki фрагменти заедно чрез запълване на нова ДНК и премахване на РНК праймери.
Фигура 02: ДНК полимераза
Pol 1, изолиран от E Coli, се използва широко в молекулярни приложения. Въпреки това, след като Taq полимеразата беше открита, тя замени E Coli Pol 1 в PCR технологията. Taq полимеразата е нещо като термостабилна ДНК полимераза, която принадлежи към Pol 1.
Какви са приликите между фрагмента на Klenow и ДНК полимераза 1?
- Кленов фрагмент е голяма част от ДНК полимераза 1.
- Те имат 5'до 3' ДНК зависима ДНК полимеразна активност и 3'до 5' екзонуклеазна активност, които медиират корекцията.
- Използват се за различни цели.
Каква е разликата между фрагмента на Klenow и ДНК полимераза 1?
Ключовата разлика между фрагмента на Кленов и ДНК полимераза 1 е, че на фрагмента на Кленов липсва 5' до 3' екзонуклеазна активност, докато ДНК полимераза 1 има 5' до 3' екзонуклеазна активност. Следователно фрагментът на Klenow има два домена, докато ДНК полимераза 1 има и трите домена.
Инфографиката по-долу показва повече подробности за разликата между фрагмента на Klenow и ДНК полимераза 1.
Резюме – Кленов фрагмент срещу ДНК полимераза 1
ДНК полимераза 1 е ензим на Е. coli, който има три домена като 5' до 3' полимеризационен домен, 3' до 5' екзонуклеазен домен и 5' до 3' екзонуклеазен домен. Фрагментът на Klenow е голяма част от ДНК полимераза. Липсва му един домен на ДНК полимераза 1, който е 5' до 3' екзонуклеазен домен. Ключовата разлика между фрагмента на Кленов и ДНК полимераза 1 е, че фрагментите на Кленов нямат 5' до 3' екзонуклеазен домен, докато ДНК полимераза 1 има 5' до 3' екзонуклеазен домен.
