Ключовата разлика между цис и транс сплайсинг е, че цис сплайсингът е вътрешномолекулен механизъм, който премахва интрони и съединява екзоните, които са в рамките на един и същ РНК транскрипт, докато транс-сплайсингът е междумолекулен механизъм, който премахва интрони или аутрони и се присъединява към екзоните, които не са в рамките на същия РНК транскрипт.
РНК сплайсингът е форма на обработка на РНК преди протеиновия синтез. В този процес, новосъздадена пре-информационна РНК транскрипция се трансформира в зряла информационна РНК. Зрялата информационна РНК помага за производството на протеинова молекула. По време на РНК снаждане, интроните (некодиращи области) се отстраняват и екзоните (кодиращи области) се обединяват, за да се получи зряла иРНК. Цис и транс сплайсингът са два вида механизми на РНК сплайсинг.
Какво е Cis снаждане?
Cis сплайсингът е вътрешномолекулен механизъм, който премахва интроните и съединява екзоните, които са в рамките на един и същи РНК транскрипт. Нормалният цис сплайсинг обработва една молекула РНК. Цис снаждането е типичният процес на сплайсинг на pre mRNA, извършван от сплайсозоми. В интрона донорно място (5' края на интрона), място на разклонение (близо до 3' края на интрона) и акцепторно място (3' края на интрона) са изключително важни за сплайсинг. Донорното място на снаждане включва инвариантна последователност GU в 5' края на интрона. Акцепторното място на сплайс в 3' края на интрона има инвариантна AG последователност. Нагоре по веригата от AG последователността има регион, наречен пиримидинов регион (полипиримидинов тракт). По-нагоре от полипиримидиновия тракт има точка на разклонение, която включва аденозин нуклеотид. Този нуклеотид участва в образуването на лариат.
Фигура 01: Цис и транс снаждане
Основните сплайсозоми са U1, U2, U4, U5 и U6. Сред тях U1 и U2 са много важни. При cis снаждане, U1 се свързва с 5' мястото на снаждане, а U2 се свързва с точката на разклоняване близо до 3' мястото на снаждане. U5/U4/U6 свързва екзони на 5' мястото, като U6 се свързва с U2. По-късно излиза U1. U5 се измества от екзон към интрон, а U6 се свързва в 5' мястото на снаждане. Освен това U4 също е пуснат. U6/U2 катализира трансестерификацията, правейки 5'-края на интрона лигатен към А нуклеотида на интрона. Това задейства образуването на лариат. При образуването на лариат, U5 свързва екзона на 3' мястото на снаждане и 5' мястото се разцепва. В крайната фаза на сплайсинг U2/U5/U6 остават свързани с лариата и 3' мястото се разцепва. В допълнение към това, екзоните се лигират с помощта на АТФ хидролиза в тази фаза.
Какво е транс сплайсинг?
Транс сплайсингът е междумолекулен механизъм, който премахва интрони или аутрони и съединява екзоните, които не са в рамките на същия РНК транскрипт. При транс-сплайсинг няма 5' място на снаждане на молекулата на pre mRNA, за да се свърже протеинът U1. Вместо това, ограничената сплайс лидерна (SL) РНК се транс-сплайсира към последователност в аутрона.
Фигура 02: Транс снаждане
Outron е регион на pre mRNA между 5' капачката и мястото на транс снаждане. Въпреки това U2 протеинът обикновено се свързва с 3' мястото на снаждане. След отстраняване на outron, водещият (SL) екзон се снажда към първия екзон на пре иРНК. Освен това, транс-сплайсингът е механизъм, който се наблюдава при определени микроорганизми като протисти от клас Kinetoplastae за експресиране на гени.
Какви са приликите между Cis и Trans сплайсинг?
- Cis и транс сплайсингът са два вида механизми на РНК сплайсинг.
- И в двата механизма интроните се премахват.
- Освен това и при двата механизма екзоните се свързват, за да образуват зряла иРНК.
- И двата механизма се срещат при еукариотите.
- Тези механизми липсват при прокариотите.
Каква е разликата между Cis и Trans сплайсинг?
Cis сплайсингът е вътрешномолекулен механизъм, който премахва интрони и съединява екзоните, които са в рамките на една и съща РНК транскрипция, докато транс-сплайсингът е междумолекулен механизъм, който премахва интрони или аутрони и съединява екзоните, които не са в рамките на същата РНК препис. И така, това е ключовата разлика между цис и транс сплайсинг. Освен това, при цис сплайсинг, интроните се отстраняват, за да се образува зряла иРНК. От друга страна, при транс сплайсинг интроните или аутроните се отстраняват, за да се образува зряла иРНК.
Следващата инфографика изброява разликите между цис и транс сплайсинг в таблична форма за сравнение едно до друго.
Резюме – Cis vs Trans снаждане
РНК сплайсингът е форма на обработка на РНК преди процеса на протеинов синтез. Цис и транс сплайсинг са два вида механизми на РНК сплайсинг, които се срещат в еукариотите. Цис сплайсингът е вътрешномолекулен механизъм, който премахва интрони и се присъединява към екзоните, които са в рамките на един и същ РНК транскрипт, докато транс-сплайсингът е междумолекулен механизъм, който премахва интрони или аутрони и съединява екзоните, които не са в рамките на същия РНК транскрипт. По този начин, това приключва дискусията за разликата между цис и транс сплайсинг.
