Ключовата разлика между насочената и ненасочената протеомика е, че насочената протеомика цели измерване на изобилието на конкретен протеин, докато ненасочената протеомика не е насочена към специфичен протеин.
Протеомиката е широкомащабно изследване на протеините, техните структури и функции. Той изучава целия протеинов комплемент в клетка, тъкан или организъм при специфични условия. Има два вида протеомика като насочена протеомика и ненасочена протеомика.
Какво е насочена протеомика?
Както подсказва името му, целевата протеомика е насочена към специфичен протеин или пептид в сложна смес от протеини за анализ. След това анализира наличието и количеството на този предварително избран специфичен протеин. Този метод е възможен само за една проба или за множество проби. Този метод е подходящ дори за определена група протеини. Това води до по-точни, количествени и чувствителни данни. Освен това, масспектрометрията, съчетана с насочена протеомика, произвежда по-точни надеждни измервания. Този метод използва троен квадруполен масспектрометър (QQQ) за своя анализ.
Фигура 01: Протеомика
Целевата протеомика е подходящ метод, ако искате да проверите дали нокдаун целта действително е унищожена или когато искате да определите количествено конкретен протеин/пептид в кръвен серум, церебрална течност или в клетъчен лизат и т.н. Можете също така използвайте го, ако искате да проверите дали конкретен протеин е диференциално експресиран в проби или по време на експеримент във времето.
Какво е ненасочена протеомика?
Ненасочената протеомика, както споменава името, не е насочена към специфичен протеин или пептид за своя анализ. Протеомиката на откриването е другото име за ненасочената протеомика. Всъщност това е по-глобален анализ. Като цяло извършването на нецеленасочена протеомика е да се отговори на въпроса „какъв протеин или протеини има в тази проба или множество проби?“. Този метод не е чувствителен като насочена протеомика. Но той може да идентифицира и измерва много протеини, включително нови протеини. Ненасочената протеомика може да произведе както количествени, така и качествени измервания.
Какви са приликите между насочената и ненасочената протеомика?
- Както насочената, така и ненасочената протеомика измерват протеините в проби.
- Те са важни в анализа на протеомите.
- Тези методи използват масспектрометрия.
Каква е разликата между насочената и ненасочената протеомика?
Първо, насочената протеомика е определянето на присъствието и количеството на определен протеин или пептид в сложна смес от протеини. За разлика от това, ненасочената протеомика е количествено и качествено изследване на протеини, присъстващи в проба или проби, без да се насочва към определен протеин. Насочената протеомика се извършва с предварително избрани или насочени протеини, докато ненасочената протеомика се извършва, за да се открият видовете протеини в тази проба. Освен това насочената протеомика е по-чувствителна от ненасочената протеомика.
Обобщение – Целенасочена срещу ненасочена протеомика
За да обобщим, насочената и ненасочената протеомика са два вида изследвания на протеини. Както подсказват имената им, насочената протеомика е насочена към специфичен протеин, докато ненасочената протеомика не е насочена към специфичен протеин. Това е разликата между насочената и ненасочената протеомика.
