Ключовата разлика между синтенията и колинеарността е, че синтенията е физическата съвместна локализация на генетични локуси на една и съща хромозома във видовете, докато колинеарността е физическата съвместна локализация на генетични локуси на една и съща хромозома в различни запазващи видове същата поръчка.
Синтения и колинеарност са два термина, които се използват взаимозаменяемо в геномиката. И двата термина описват моделите на локализация на гена върху хромозомите при различни видове. Тези свързани генни подредби сред таксоните са ценна информация, когато се прави извод за споделено потекло на гените. Синтенията се отнася до физическата съвместна локализация на генетични локуси на една и съща хромозома във видовете. Колинеарността се отнася до физическата съвместна локализация на генетични локуси на една и съща хромозома в различни видове, запазвайки същия ред. Следователно това е форма на синтения.
Какво е Synteny?
При различните видове има набор от гени, разположени на една и съща хромозома. И тази физическа съвместна локализация на гени на една и съща хромозома в различни видове е известна като синтения. Освен това тези гени се намират много близо един до друг на една хромозома. Редът на гените може да не е непременно същият. Но локализирането на гени близо един до друг на една и съща хромозома се извършва в синхрон. Следователно синтенията описва главно модела на разпределение на гените върху хромозомата. Тези модели на съвместна локализация на гени показват връзки между различни видове и тяхната еволюция. Синтенията обаче може да бъде нарушена поради хромозомни пренареждания като транслокации, инверсия и сливане на хромозоми и т.н. дублиране, загуба и нееднаква хомоложна рекомбинация.
Фигура 01: Synteny
Смята се, че всички свързани гени са синтетични. Въпреки това, не всички синтетични гени са непременно свързани. Те притежават общи хромозомни последователности. Хората имат много синтетични гени с други бозайници. Освен това много зърнени култури имат синтетични гени.
Какво е колинеарност?
Колинеарността е по-специфична форма на синтения, при която набор от гени са разположени на една и съща хромозома на различни видове в същия ред, както при предшествениците. Следователно, ако има отклонение от колинеарността, това ще бъде по-надежден филогенетичен характер, тъй като колинеарността обяснява споделеното потекло на гените.
Фигура 02: Колинеарност
Многостранният колинеарен анализ предоставя много по-надеждна информация за сродните видове и тяхната филогенеза.
Какви са приликите между синтенията и колинеарността?
- Както в синтенията, така и в колинеарността, набор от локуси в два различни вида се намира на една и съща хромозома.
- Тези термини описват физическата съвместна локализация на генетични локуси на една и съща хромозома.
- Колинеарността е по-специфична форма на синтения.
- Понякога и двата термина се използват взаимозаменяемо в геномиката.
- Ако две области имат колинеарност, те очевидно са синтетични.
- Полезни са при извеждане на филогенезата.
Каква е разликата между синтения и колинеарността?
Синтения и колинеарност са два термина, които се използват взаимозаменяемо в геномиката. Синтенията се отнася до физическата съвместна локализация на набор от гени в една и съща хромозома при различни видове. Колинеарността е форма на синтения, при която наборът от гени е съвместно локализиран в същия ред сред различните видове. Следователно това е ключовата разлика между синтенията и колинеарността.
Резюме – Synteny vs Collinearity
Термините синтения и колинеарност се отнасят до набор от гени, които са разположени на една и съща хромозома при различни видове. Всъщност тези гени са локализирани в една и съща хромозома при различни видове. Синтенията описва физическата съвместна локализация на набор от гени на една и съща хромозома при различни видове, докато колинеарността е по-специфична форма на синтения, при която наборът от гени е локализиран съвместно в същия ред. По този начин това обобщава разликата между синтения и колинеарност.
