Ключовата разлика между CDS и ORF е, че CDS е тази действителна нуклеотидна последователност на ген, която се транслира в протеин, докато ORF е участък от ДНК последователност, която започва с място за иницииране на транслацията (начален кодон) и завършва с сайт за прекратяване на превода (стоп кодон).
Генът има кодираща последователност (CDS). Състои се от общи екзони на гена и начален кодон и стоп кодон. Това е действителната част от гена, която транслира и произвежда протеина. Отворената четяща рамка или ORF е нуклеотидна последователност, разположена между начален кодон и стоп кодон. В ORF няма стоп кодон, който прекъсва генетичния код, който се превежда в протеин. При прокариотите CDS и ORF на ген са еднакви.
Какво е CDS?
CDS или кодиращата последователност е частта от гена, която всъщност се преобразува в протеин. Състои се от екзони и два кодона, известни като AUG кодон и стоп кодон. CDS не съдържа два непреведени региона: 5' UTR и 3 UTR. Освен това интроните не са включени в CDS.
Фигура 01: Последователност на кодиране
В сравнение с целия геном на индивида, кодиращите последователности са малка част. Кодиращата последователност се състои от необходимата нуклеотидна последователност за създаване на аминокиселинната последователност на протеина. Следователно CDS са концентрирани екзони, които могат да бъдат разделени на нуклеотидни триплети или кодони. Кодоните пораждат аминокиселини.
Какво е ORF?
Отворената четяща рамка или ORF е непрекъснатото участък на нуклеотидна последователност, която започва със стартов кодон и завършва със стоп кодон. С прости думи, ORF се отнася до областта на нуклеотидната последователност, разположена между началния и стоп кодона. Между тях няма стоп кодон, прекъсващ ORF. Нуклеотидната последователност между началния и стоп кодона кодира аминокиселини. Обикновено началният кодон е ATG, докато стоп кодоните са TAG, TAA и TGA. ORF дава функционален протеин, когато се транскрибира и транслира. Следователно, ORF включва начален кодон, няколко кодона в средната област и стоп кодон. Интересното е, че ORF има дължина, която може да бъде разделена на три.
Фигура 02: Отворена рамка за четене
При прокариотите, тъй като няма интрони, ORF е кодиращата последователност на ген, който се транскрибира директно в иРНК. Следователно CDS и PRF са еднакви при прокариотите. Когато търсите гени в прокариоти, е лесно да откриете ORF и да намерите ген в прокариоти. При еукариотите, тъй като има интрони, ORF е последователността на кодона, която се образува след обработка или снаждане на РНК. ORF е част от доказателството, което подпомага прогнозирането на гена, докато има вероятност ORF да е част от ген.
Какви са приликите между CDS и ORF?
- При прокариотите CDS и ORF са еднакви.
- И двете имат начален кодон и стоп кодон.
- Те имат определен брой нуклеотиди, които могат да бъдат разделени на три.
- След като преведат, те произвеждат аминокиселинни последователности.
Каква е разликата между CDS и ORF?
CDS е действителната част от гена, която се преобразува в протеин, докато ORF е участъкът от ДНК между начален кодон и стоп кодон. И така, това е ключовата разлика между CDS и ORF. Освен това, CDS не съдържа интрони, но ORF може да съдържа интрони. CDS транскрибира напълно в пълна иРНК последователност, докато ORF може да бъде част от иРНК последователността. По този начин, това е друга разлика между CDS и ORF.
По-долу инфографиката показва една до друга разликите между CDS и ORF.
Обобщение – CDS срещу ORF
CDS и ORF са две важни части от гена. CDS се отнася до действителната област на ДНК, която се преобразува в протеин. ORF е последователност от ДНК, която започва с начален кодон „ATG“и завършва с който и да е от трите терминиращи кодона (TAA, TAG или TGA). ORF може да бъде част от пълната иРНК на ген. Въпреки това, кодиращата последователност на гена се транскрибира до пълна иРНК последователност. Всички CDS са ORF. Но не всички ORF са CDS. Така това обобщава разликата между CDS и ORF.
