Ключова разлика – VNTR срещу STR
ДНК изследванията имат огромна полза при разбирането и определянето на филогенетичните връзки, диагностицирането на генетични заболявания и картографирането на геномите на организмите. Няколко техники, свързани с ДНК анализа, се използват за идентифициране на определен ген или ДНК последователност в набор от неизвестна ДНК. Те са известни като генетични маркери. Генетичните маркери се използват в молекулярната биология за идентифициране на генетични вариации между индивиди и видове. Тандемно повторение с променлив брой (VNTR) и кратко тандемно повторение (STR) са два вида генетични маркери, които показват полиморфизъм сред индивидите. И двата типа са некодиращи повтарящи се ДНК, които са тандемни повторения. Те са подредени от главата до опашката в хромозомите. VNTR е част от генома, където късата нуклеотидна последователност се повтаря няколко пъти. STR е друг участък от ДНК в генома, който е организиран като повтарящи се единици, състоящи се от два до тринадесет нуклеотида в сто пъти. Ключовата разлика между VNTR и STR е броят на нуклеотидите в повтаряща се последователност. Повтарящите се единици на VNTR се състоят от 10 до 100 нуклеотида, докато повтарящата се единица на STR се състои от 2 до 13 нуклеотида. VNTR и STR се използват широко в криминалистичните изследвания.
Какво е VNTR?
Тандемното повторение е кратка последователност от ДНК, която се повтаря от главата до опашката в специфичен хромозомен локус. Няма друга последователност или нуклеотид в тандемното повторение. В генома има няколко вида тандемни повторения. VNTR е вид тандемно повторение сред тях, което има повтарящи се единици, състоящи се от 10 до 100 нуклеотида. VNTR е вид минисателит. Тези тандемни повторения могат да бъдат намерени в много хромозоми. Те са разпръснати в човешкия геном и са разположени предимно в субтеломерните области на хромозомите.
VNTRs показват тандемен повтарящ се полиморфизъм сред индивидите. Дължината на VNTR в определено място на хромозомата е силно променлива сред индивидите поради вариацията в броя на повтарящите се единици, организирани в тази ДНК секция. Поради това VNTR може да се използва като мощен инструмент при идентифицирането на индивиди и VNTR анализът се използва в много области, включително генетика, биологични изследвания, съдебна медицина и ДНК пръстов отпечатък. VNTRs бяха първите генетични маркери, използвани за количествено определяне на присаждането на трансплантация на костен мозък. VNTRs също бяха първите полиморфни маркери, използвани в ДНК профилирането в криминалистиката.
Фигура 01: Вариация на VNTR при шест индивида
VNTR анализът се извършва чрез полиморфизъм на дължината на рестрикционния фрагмент, последван от южна хибридизация. Следователно се нуждае от сравнително голяма ДНК проба. Интерпретацията на профила на VNTR също е проблематична. Поради тези ограничения, използването на VNTR в съдебната генетика е ограничено и е заменено от STR анализ.
Какво е STR?
STR е силно повтаряща се ДНК секция, която се състои от две до тринадесет повтарящи се нуклеотидни единици, организирани по тандемен начин. STR е подобен на VNTR. Но варира от VNTR от броя на нуклеотидите в повтаряща се последователност и броя на повторенията. STR е вид микросателит.
STR анализ, участващ в измерването на точния брой повтарящи се единици. STR са силно променливи сред индивидите, подобно на VNT. STR профилите се различават от човек на човек. Следователно STR анализът се използва в молекулярната биология за сравняване на специфични локуси на ДНК от две или повече проби. Следователно STR се считат за мощни генетични маркери в молекулярната биология. Той предоставя отличен инструмент за идентифициране на индивиди поради тяхната висока степен на полиморфизъм и относително къса дължина.
Понастоящем STR са най-често използваният инструмент за анализ на генетичен полиморфизъм в съдебната генетика. Повечето криминалистични казуси включват STR полиморфен анализ. STR локусите са разпространени в целия геном. Има хиляди STRs, разположени в хромозомите, които могат да се използват в криминалистичния анализ. STR анализът не включва полиморфизъм на дължината на ограничението като VNTR анализа. STR анализът не разрязва ДНК с рестрикционни ензими. Използват се специфични сонди за прикрепване на желани региони към ДНК и с помощта на PCR техника се определят дължините на STR.
Фигура 02: Вариация на STR между проби
Какви са приликите между VNTR и STR?
- VNTR и STR са некодираща ДНК.
- И двете са тандемни повторения.
- И двете показват полиморфизъм сред индивидите поради разликата в дължината на секцията на ДНК.
- И двата се използват като мощни генетични маркери в ДНК пръстови отпечатъци и в криминалистични изследвания.
Каква е разликата между VNTR и STR?
VNTR срещу STR |
|
| VNTR е некодираща повтаряща се ДНК, която има къса нуклеотидна последователност, повтаряща се по тандемен начин. | STR е силно повтаряща се ДНК секция, която се състои от две до тринадесет нуклеотидни повтарящи се единици, организирани по тандемен начин. |
| Размер | |
| VNTR са по-големи от STR. | STR са по-малки от VNTR. |
| Брой нуклеотиди в повтаряща се последователност | |
| Повтарящата се единица на VNTR се състои от 10 до 100 нуклеотида. | Повтарящата се единица на STR се състои от 2 до 13 нуклеотида. |
Обобщение – VNTR срещу STR
VNTR и STR са два мощни генетични маркера, използвани в молекулярната биология, особено в областта на съдебната генетика. VNTR е вид минисателит, а STR е микросателит. VNTR и STR са некодираща, силно повтаряща се ДНК. Те са тандемни повторения. Общата структура на VNTR и STR е една и съща. Въпреки това, броят на нуклеотидите в повтарящата се последователност и дължината са различни. VNTR има повтарящи се последователности, състоящи се от 10 до 100 нуклеотида. STR има повтарящи се последователности, състоящи се от 2 до 13 нуклеотида. Това е разликата между VNTR и STR.
Изтеглете PDF версия на VNTR срещу STR
Можете да изтеглите PDF версия на тази статия и да я използвате за офлайн цели според бележките за цитиране. Моля, изтеглете PDF версия тук Разлика между VNTR и STR.
