Ключовата разлика между фикоцианин и алофикоцианин е, че фикоцианинът абсорбира и излъчва при по-къси дължини на вълните от алофикоцианина.
Фикобилипротеините са семейство водоразтворими протеини, които присъстват в цианобактериите и някои видове водорасли. Фикоцианинът и алофикоцианинът са два основни члена на това семейство.
Какво е фикоцианин?
Фикоцианинът е пигментно-протеинов комплекс от семейството на събиращите светлина фикобилипротеини. Други важни членове на това семейство включват алофикоцианин и фикоеритрин. Този пигмент е допълнителен пигмент към хлорофила. Като цяло всички фикобилипротеини са водоразтворими комплекси, които не могат да съществуват в мембраните като каротеноидите. Вместо да съществуват в мембраните, тези пигменти са склонни да се агрегират, образувайки клъстери, които могат да се придържат към мембраните, известни като фикобилизоми.
Фигура 01: Екстрахирани фикоцианинови пигменти (от цианобактерии)
Можем да наблюдаваме, че фикоцианинът има характерен светлосин цвят, който може да абсорбира оранжева и червена светлина (близо 620 nm) и може да излъчва флуоресценция (около 650 nm). Можем да намерим този цветен пигмент в цианобактериите и името „Phycocyanin“идва от гръцкото значение на „Phyco“, което се отнася за „водорасли“и наставката „cyanin“от гръцкото значение за „Kyanos“, което се отнася до „тъмно синьо“.
Обикновено молекулите на фикоцианина споделят обща структура с всички фикобилипротеини. Когато се разглежда структурата на този пигмент, тя започва със сглобяването на фикобилипротеинови мономери. Тези мономери са хетеродимери, състоящи се от алфа и бета субединици със съответните им хромофори. Хромофорите и субединиците са свързани заедно чрез тиоетерна химична връзка.
Субединиците на структурата на фикоцианина обикновено съдържат осем алфа-спирали. Мономерните структури са склонни спонтанно да се агрегират, образувайки пръстеновидни тримери, имащи ротационна симетрия и централен канал. Освен това, тримерите са склонни да се агрегират по двойки, образувайки хексамери, които са подпомогнати с допълнителни линкерни протеини. Следователно всяка фикобилизомна пръчка съдържа два или повече фикоцианинови хексамера.
Какво е алофикоцианин?
Алофикоцианинът е протеинова молекула, която идва от семейството на фикобилипротеините и е допълнителен пигмент към хлорофила. Другите членове на това светлосъбиращо семейство фикобилипротеини включват фикоцианин, фикоеритрин и фикоеритроцианин. Алофикоцианиновите пигменти могат да абсорбират и излъчват червена светлина и можем лесно да открием този пигмент в цианобактерии и червени водорасли.
Фигура 02: Външен вид на алофикоцианин в диаграма
Можем да изолираме алофикоцианин от различни видове червени или синьо-зелени водорасли. Тези водорасли произвеждат малко по-различни форми на молекулата. Обикновено молекулата на алофикоцианина съдържа две различни субединици, наречени алфа и бета субединица. Всяка субединица има един фикоцианобилинов хромофор.
Има различни приложения на алофикоцианина; много инструменти са разработени специално за алофикоцианин. Например, този компонент обикновено се използва в имуноанализи, включително FACS, поточна цитометрия и др.
Какви са приликите между фикоцианин и алофикоцианин?
- Фикоцианинът и алофикоцианинът са водоразтворими протеини
- И двете са включени в семейството на фикобилипротеините.
Каква е разликата между фикоцианин и алофикоцианин?
Фикобилипротеините са семейство водоразтворими протеини, които присъстват в цианобактериите и някои видове водорасли. Фикоцианинът и алофикоцианинът са два основни члена на това семейство. Ключовата разлика между фикоцианин и алофикоцианин е, че фикоцианинът абсорбира и излъчва при по-къси дължини на вълната от алофикоцианина.
По-долу инфографиката изброява повече разлики между фикоцианин и алофикоцианин в таблична форма за сравнение едно до друго.
Обобщение – фикоцианин срещу алофикоцианин
Фикобилипротеините са семейство водоразтворими протеини, които присъстват в цианобактериите и някои видове водорасли. Фикоцианинът и алофикоцианинът са два основни члена на това семейство. Ключовата разлика между фикоцианин и алофикоцианин е, че фикоцианинът абсорбира и излъчва при по-къси дължини на вълните от алофикоцианина.