Ключовата разлика между линкер и адаптер е, че линкерът няма сплотени краища, докато адаптерът има един сплотен край.
ДНК лигирането е процес на свързване на две ДНК молекули заедно, образувайки фосфодиестерни връзки. Ензимът, наречен ДНК лигаза, катализира тази реакция. Това е една от критичните стъпки в съвременните молекулярно-биологични области като рекомбинантна ДНК технология и ДНК клониране. Ефективността на лигирането зависи от краищата на ДНК молекулите, които трябва да се лигират. Има два вида краища на ДНК като лепкави краища и тъпи краища. Ефективността на лигирането е висока при лепкави краища, отколкото при тъпи краища. Ако целевите ДНК молекули имат тъпи краища, ще бъдат полезни молекули, наречени адаптери или линкери. Адаптерите и линкерите са химически синтезирани олигонуклеотидни молекули, които помагат при лигирането на ДНК. Имат и вътрешни сайтове за ограничаване. Адаптерът има един лепкав край и един тъп край, докато линкерът има два тъпи края.
Какво е Linker?
Линкерът е химически синтезирана олигонуклеотидна последователност, която е двойно-верижна. Linker има два тъпи края. Линкерът се използва за лигиране на ДНК молекули, които имат тъпи краища към вектори. Той съдържа един или повече вътрешни рестрикционни сайтове. Тези рестрикционни сайтове работят като сайтове за разпознаване на рестрикционни ензими.
Фигура 01: Линкер
След лигиране, ДНК се ограничава отново с рестрикционни ензими, за да се получат кохезивни краища. EcoRI-линкерите и sal-I линкерите са често използвани линкери.
Какво е адаптер?
Адаптерът е двуверижна олигонуклеотидна последователност, използвана за свързване на две ДНК молекули заедно. Това е кратка последователност с един тъп край и един лепкав или слепващ край. Следователно, той се състои от едноверижна опашка в единия край, което подобрява ефективността на лигирането на ДНК.
Фигура 02: Лигиране на ДНК чрез адаптер
Освен това, адаптерът има вътрешни сайтове за ограничаване. Следователно, след лигиране, ДНК може да бъде ограничена с подходящи рестрикционни ензими, за да се създаде нов изпъкнал край. Един недостатък на адаптерите е, че два адаптера могат да образуват димери чрез сдвояване на основата със себе си. Това може да се избегне чрез третирането им с ензима, наречен алкална фосфатаза.
Какви са приликите между Linker и Adaptor?
- И линкерът, и адаптерът са двойноверижни къси олигонуклеотидни последователности.
- Те носят вътрешни сайтове за ограничаване.
- Освен това, те са химически синтезирани ДНК молекули и са синтетични молекули.
- Те могат да свържат две ДНК молекули заедно.
- След лигиране на линкери и адаптори, ДНК отново се ограничава с рестрикционни ензими, за да се получат лепкави краища.
Каква е разликата между Linker и Adaptor?
Линкерът е химически синтезиран къс олигонуклеотиден дуплекс с два тъпи края. Адаптерът е химически синтезиран къс олигонуклеотиден дуплекс с един лепкав и един тъп край. По този начин, това е ключовата разлика между линкер и адаптер. Освен това адаптерите могат да образуват димери, докато линкерите не образуват димери. И така, това е друга съществена разлика между линкер и адаптер.
По-долу е обобщение на разликите между линкер и адаптер в таблична форма.
Резюме – Линкер срещу адаптер
Линкерът и адаптерът са два вида химически синтезирани олигонуклеотиди, които са полезни при лигиране на ДНК с тъп край. Линкерът има два тъпи края, докато адаптерът има един тъп край и един кохезивен край. И така, това е ключовата разлика между линкер и адаптер. Те са двуверижни молекули, които имат вътрешни рестрикционни места. Те се използват широко в рекомбинантната ДНК технология и ДНК клонирането.
