Ключовата разлика между LINE и SINE е, че LINEs (дълги разпръснати ядрени елементи) са вид по-дълги не-LTR ретротранспозони, докато SINE (къси разпръснати ядрени елементи) са вид много по-къси не-LTR ретротранспозони.
Не-LTR ретротранспозони не съдържат дълги крайни повторения (LTR). Те обаче съдържат гени за обратна транскриптаза, РНК свързващ протеин, нуклеаза и рибонуклеазен Н домейн. Не-LTR ретротранспозоните имат кратки повторения. Тези повторения имат обърнат ред на бази една до друга. Освен това, не-LTR ретротранспозоните също имат директни повторения, открити в LRT транспозоните. Не-LTR ретротранспозоните попадат в две категории като LINEs и SINEs.
Какво представляват ЛИНИИТЕ?
LINEs (дълги разпръснати ядрени елементи) са по-дълги не-LTR ретротранспозони. Те са широко разпространени в геномите на еукариотите. Те обикновено съставляват 21,1% от човешкия геном. Всяка ЛИНИЯ е дълга около 7000 базови двойки. LINE могат да се транскрибират в иРНК и да се транслират в протеин, който може да функционира като ензим за обратна транскриптаза. Тази обратна транскриптаза произвежда ДНК копия на LINEs РНК. Тези ДНК копия могат да бъдат интегрирани в генома на ново място.
Фигура 01: ЛИНИИ и СИНУСИ
Човешкият геном има само една изобилна ЛИНИЯ, наречена ЛИНИЯ-1. Елементът LINE-1 е дълъг около 6000 базови двойки. В човешкия геном има около 100 000 съкратени елемента LINE-1. Случайна мутация може да възникне в LINEs. Поради произволни мутации ЛИНИИТЕ могат да се изродят. Вече не се транскрибират или превеждат. Освен това LINEs са групирани в пет основни групи като L1, RTE, R2, I и jockey. Тези пет групи допълнително се подразделят на още 28 клада.
LINEs обикновено се разпространяват чрез механизъм, наречен механизъм за обратна транскрипция с прицелно праймиране (TPRT). Вмъкването на LINEs причинява човешки заболявания като хемофилия А, рак, менделски разстройства и т.н. Хипометилирането на LINEs също предизвиква определени видове рак.
Какво представляват SINE?
SINEs (къси разпръснати ядрени елементи) са вид много по-къси не-LTR ретротранспозони. Те са с дължина около 100 до 700 базови двойки. SINE също са ДНК елементи, които се амплифицират в еукариотните геноми чрез РНК междинни продукти. SINE съставляват около 13% от генома на бозайниците. Вътрешните региони на SINEs произлизат от tRNA. Остава много запазен. Те често присъстват в много видове гръбначни и безгръбначни. Вариациите в броя на копията и мутациите в SINE могат да бъдат включени, за да се изгради базирана на филогенеза класификация на видовете.
SINEs могат да бъдат групирани в три основни типа: CORE-SINEs, V-SINEs и AmnSINEs. Alu елементът е най-често срещаният SINE при приматите. Освен това има повече от 50 човешки заболявания, свързани с вмъкването на SINE. Когато се вмъкнат в или близо до екзони, те могат да причинят неправилно снаждане или да променят рамката за четене. Това води до фенотипове на заболяване като рак на гърдата, рак на дебелото черво, левкемия, хемофилия, кистозна фиброза, рак на дебелото черво, болест на Дент, неврофиброматоза и др.
Какви са приликите между ЛИНИИ и СИНУСИ?
- LINEs и SINE са два типа не-LTR ретротранспозони.
- И двете нямат дълги крайни региони (LTR).
- И двете се срещат предимно само в еукариотите.
- И двамата са неавтономни.
Каква е разликата между ЛИНИИ и СИНУСИ?
LINEs са по-дълги не-LTR ретротранспозони, докато SINE са много по-къси не-LTR ретротранспозони. И така, това е ключовата разлика между LINEs и SINEs. Освен това LINES кодира ензим обратна транскриптаза, докато SINE не кодира ензим обратна транскриптаза. По този начин, това е друга разлика между ЛИНИИ и СИНУСИ.
Още разлики между LINEs и SINEs са изброени по-долу в таблична форма за сравнение едно до друго.
Обобщение – ЛИНИИ срещу СИНУСИ
Ретротранспозоните се срещат главно във всички еукариоти, но липсват при прокариотите. Приблизително 37% от човешкия геном съдържа ретротранспозони. Ретротранспозоните са основно два вида: LTR и не-LTR ретротранспозони. Не-LTR ретротранспозоните не съдържат дълги крайни повторения (LTR), които присъстват в LTR ретротранспозоните. Не-LTR ретротранспозоните се разделят допълнително на две категории: LINE и SINE. LINE са по-дълги не-LTR ретротранспозони, докато SINE са много по-къси не-LTR ретротранспозони. По този начин, това е обобщението на разликата между LINEs и SINEs.
